Protein–RNA interactions for Protein: Q96M19

LINC00477, Putative transmembrane protein encoded by LINC00477, humanhuman

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00477Q96M19 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00477Q96M19 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00477Q96M19 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00477Q96M19 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00477Q96M19 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00477Q96M19 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00477Q96M19 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00477Q96M19 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00477Q96M19 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00477Q96M19 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00477Q96M19 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00477Q96M19 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00477Q96M19 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00477Q96M19 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00477Q96M19 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00477Q96M19 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00477Q96M19 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00477Q96M19 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00477Q96M19 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00477Q96M19 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00477Q96M19 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00477Q96M19 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00477Q96M19 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00477Q96M19 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00477Q96M19 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00477Q96M19 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00477Q96M19 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00477Q96M19 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00477Q96M19 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00477Q96M19 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00477Q96M19 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00477Q96M19 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00477Q96M19 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00477Q96M19 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00477Q96M19 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00477Q96M19 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00477Q96M19 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00477Q96M19 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00477Q96M19 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00477Q96M19 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00477Q96M19 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00477Q96M19 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00477Q96M19 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00477Q96M19 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00477Q96M19 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00477Q96M19 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00477Q96M19 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00477Q96M19 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00477Q96M19 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00477Q96M19 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00477Q96M19 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00477Q96M19 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00477Q96M19 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00477Q96M19 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00477Q96M19 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00477Q96M19 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00477Q96M19 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00477Q96M19 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00477Q96M19 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00477Q96M19 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00477Q96M19 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00477Q96M19 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00477Q96M19 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00477Q96M19 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00477Q96M19 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00477Q96M19 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00477Q96M19 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00477Q96M19 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00477Q96M19 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00477Q96M19 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00477Q96M19 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00477Q96M19 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00477Q96M19 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00477Q96M19 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00477Q96M19 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00477Q96M19 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00477Q96M19 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00477Q96M19 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00477Q96M19 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00477Q96M19 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
LINC00477Q96M19 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
LINC00477Q96M19 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00477Q96M19 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00477Q96M19 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00477Q96M19 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00477Q96M19 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00477Q96M19 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00477Q96M19 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00477Q96M19 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00477Q96M19 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00477Q96M19 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00477Q96M19 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00477Q96M19 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00477Q96M19 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00477Q96M19 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00477Q96M19 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00477Q96M19 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00477Q96M19 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00477Q96M19 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00477Q96M19 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms