Protein–RNA interactions for Protein: Q96L91

EP400, E1A-binding protein p400, humanhuman

Predictions only

Length 3,159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EP400Q96L91 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
EP400Q96L91 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
EP400Q96L91 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
EP400Q96L91 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
EP400Q96L91 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
EP400Q96L91 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
EP400Q96L91 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
EP400Q96L91 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
EP400Q96L91 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
EP400Q96L91 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
EP400Q96L91 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
EP400Q96L91 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
EP400Q96L91 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
EP400Q96L91 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC29.06■■■□□ 2.24
EP400Q96L91 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
EP400Q96L91 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
EP400Q96L91 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
EP400Q96L91 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
EP400Q96L91 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
EP400Q96L91 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
EP400Q96L91 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
EP400Q96L91 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
EP400Q96L91 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
EP400Q96L91 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
EP400Q96L91 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
EP400Q96L91 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
EP400Q96L91 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
EP400Q96L91 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
EP400Q96L91 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
EP400Q96L91 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
EP400Q96L91 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
EP400Q96L91 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
EP400Q96L91 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
EP400Q96L91 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
EP400Q96L91 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
EP400Q96L91 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
EP400Q96L91 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
EP400Q96L91 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
EP400Q96L91 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
EP400Q96L91 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
EP400Q96L91 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
EP400Q96L91 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
EP400Q96L91 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC29.03■■■□□ 2.24
EP400Q96L91 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
EP400Q96L91 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
EP400Q96L91 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
EP400Q96L91 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
EP400Q96L91 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
EP400Q96L91 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
EP400Q96L91 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
EP400Q96L91 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
EP400Q96L91 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
EP400Q96L91 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
EP400Q96L91 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
EP400Q96L91 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
EP400Q96L91 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
EP400Q96L91 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
EP400Q96L91 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.24
EP400Q96L91 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
EP400Q96L91 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
EP400Q96L91 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC29.01■■■□□ 2.24
EP400Q96L91 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.24
EP400Q96L91 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
EP400Q96L91 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.24
EP400Q96L91 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
EP400Q96L91 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
EP400Q96L91 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
EP400Q96L91 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
EP400Q96L91 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
EP400Q96L91 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
EP400Q96L91 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
EP400Q96L91 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
EP400Q96L91 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
EP400Q96L91 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
EP400Q96L91 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC29■■■□□ 2.23
EP400Q96L91 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
EP400Q96L91 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC29■■■□□ 2.23
EP400Q96L91 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
EP400Q96L91 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
EP400Q96L91 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
EP400Q96L91 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
EP400Q96L91 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
EP400Q96L91 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
EP400Q96L91 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
EP400Q96L91 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
EP400Q96L91 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
EP400Q96L91 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
EP400Q96L91 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
EP400Q96L91 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
EP400Q96L91 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
EP400Q96L91 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
EP400Q96L91 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
EP400Q96L91 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
EP400Q96L91 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
EP400Q96L91 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
EP400Q96L91 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
EP400Q96L91 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
EP400Q96L91 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
EP400Q96L91 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
EP400Q96L91 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms