Protein–RNA interactions for Protein: Q96HD1

CRELD1, Cysteine-rich with EGF-like domain protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRELD1Q96HD1 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CRELD1Q96HD1 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CRELD1Q96HD1 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CRELD1Q96HD1 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CRELD1Q96HD1 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CRELD1Q96HD1 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CRELD1Q96HD1 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CRELD1Q96HD1 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CRELD1Q96HD1 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CRELD1Q96HD1 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CRELD1Q96HD1 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CRELD1Q96HD1 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CRELD1Q96HD1 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CRELD1Q96HD1 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CRELD1Q96HD1 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CRELD1Q96HD1 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CRELD1Q96HD1 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CRELD1Q96HD1 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CRELD1Q96HD1 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CRELD1Q96HD1 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CRELD1Q96HD1 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CRELD1Q96HD1 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CRELD1Q96HD1 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CRELD1Q96HD1 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CRELD1Q96HD1 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CRELD1Q96HD1 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CRELD1Q96HD1 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CRELD1Q96HD1 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CRELD1Q96HD1 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CRELD1Q96HD1 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CRELD1Q96HD1 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CRELD1Q96HD1 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CRELD1Q96HD1 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CRELD1Q96HD1 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CRELD1Q96HD1 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CRELD1Q96HD1 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CRELD1Q96HD1 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CRELD1Q96HD1 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CRELD1Q96HD1 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CRELD1Q96HD1 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CRELD1Q96HD1 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CRELD1Q96HD1 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CRELD1Q96HD1 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CRELD1Q96HD1 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CRELD1Q96HD1 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CRELD1Q96HD1 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CRELD1Q96HD1 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CRELD1Q96HD1 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CRELD1Q96HD1 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CRELD1Q96HD1 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CRELD1Q96HD1 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CRELD1Q96HD1 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CRELD1Q96HD1 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CRELD1Q96HD1 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CRELD1Q96HD1 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CRELD1Q96HD1 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CRELD1Q96HD1 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CRELD1Q96HD1 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CRELD1Q96HD1 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CRELD1Q96HD1 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CRELD1Q96HD1 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CRELD1Q96HD1 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CRELD1Q96HD1 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CRELD1Q96HD1 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CRELD1Q96HD1 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CRELD1Q96HD1 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CRELD1Q96HD1 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CRELD1Q96HD1 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CRELD1Q96HD1 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CRELD1Q96HD1 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CRELD1Q96HD1 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CRELD1Q96HD1 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CRELD1Q96HD1 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CRELD1Q96HD1 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CRELD1Q96HD1 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CRELD1Q96HD1 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CRELD1Q96HD1 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CRELD1Q96HD1 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CRELD1Q96HD1 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CRELD1Q96HD1 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CRELD1Q96HD1 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CRELD1Q96HD1 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CRELD1Q96HD1 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CRELD1Q96HD1 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CRELD1Q96HD1 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CRELD1Q96HD1 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CRELD1Q96HD1 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CRELD1Q96HD1 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CRELD1Q96HD1 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CRELD1Q96HD1 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CRELD1Q96HD1 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CRELD1Q96HD1 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CRELD1Q96HD1 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CRELD1Q96HD1 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CRELD1Q96HD1 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CRELD1Q96HD1 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CRELD1Q96HD1 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CRELD1Q96HD1 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CRELD1Q96HD1 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CRELD1Q96HD1 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms