Protein–RNA interactions for Protein: Q96FT7

ASIC4, Acid-sensing ion channel 4, humanhuman

Predictions only

Length 647 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC4Q96FT7 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ASIC4Q96FT7 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ASIC4Q96FT7 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ASIC4Q96FT7 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ASIC4Q96FT7 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ASIC4Q96FT7 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ASIC4Q96FT7 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ASIC4Q96FT7 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ASIC4Q96FT7 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ASIC4Q96FT7 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ASIC4Q96FT7 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ASIC4Q96FT7 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ASIC4Q96FT7 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ASIC4Q96FT7 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ASIC4Q96FT7 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ASIC4Q96FT7 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ASIC4Q96FT7 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ASIC4Q96FT7 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ASIC4Q96FT7 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ASIC4Q96FT7 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ASIC4Q96FT7 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ASIC4Q96FT7 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ASIC4Q96FT7 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ASIC4Q96FT7 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ASIC4Q96FT7 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ASIC4Q96FT7 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ASIC4Q96FT7 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ASIC4Q96FT7 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ASIC4Q96FT7 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ASIC4Q96FT7 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ASIC4Q96FT7 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ASIC4Q96FT7 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ASIC4Q96FT7 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ASIC4Q96FT7 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ASIC4Q96FT7 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ASIC4Q96FT7 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ASIC4Q96FT7 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ASIC4Q96FT7 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ASIC4Q96FT7 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ASIC4Q96FT7 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ASIC4Q96FT7 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ASIC4Q96FT7 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ASIC4Q96FT7 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ASIC4Q96FT7 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ASIC4Q96FT7 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ASIC4Q96FT7 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ASIC4Q96FT7 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ASIC4Q96FT7 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ASIC4Q96FT7 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ASIC4Q96FT7 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ASIC4Q96FT7 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ASIC4Q96FT7 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ASIC4Q96FT7 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ASIC4Q96FT7 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ASIC4Q96FT7 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ASIC4Q96FT7 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ASIC4Q96FT7 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ASIC4Q96FT7 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ASIC4Q96FT7 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ASIC4Q96FT7 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ASIC4Q96FT7 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ASIC4Q96FT7 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ASIC4Q96FT7 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ASIC4Q96FT7 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ASIC4Q96FT7 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ASIC4Q96FT7 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ASIC4Q96FT7 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ASIC4Q96FT7 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ASIC4Q96FT7 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ASIC4Q96FT7 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ASIC4Q96FT7 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ASIC4Q96FT7 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ASIC4Q96FT7 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ASIC4Q96FT7 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ASIC4Q96FT7 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ASIC4Q96FT7 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ASIC4Q96FT7 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ASIC4Q96FT7 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ASIC4Q96FT7 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ASIC4Q96FT7 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ASIC4Q96FT7 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ASIC4Q96FT7 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ASIC4Q96FT7 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ASIC4Q96FT7 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ASIC4Q96FT7 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ASIC4Q96FT7 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ASIC4Q96FT7 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ASIC4Q96FT7 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ASIC4Q96FT7 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ASIC4Q96FT7 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ASIC4Q96FT7 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ASIC4Q96FT7 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ASIC4Q96FT7 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ASIC4Q96FT7 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ASIC4Q96FT7 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ASIC4Q96FT7 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ASIC4Q96FT7 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ASIC4Q96FT7 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ASIC4Q96FT7 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ASIC4Q96FT7 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms