Protein–RNA interactions for Protein: Q96DT6

ATG4C, Cysteine protease ATG4C, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4CQ96DT6 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATG4CQ96DT6 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATG4CQ96DT6 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATG4CQ96DT6 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATG4CQ96DT6 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATG4CQ96DT6 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATG4CQ96DT6 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATG4CQ96DT6 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATG4CQ96DT6 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATG4CQ96DT6 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATG4CQ96DT6 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATG4CQ96DT6 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATG4CQ96DT6 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATG4CQ96DT6 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATG4CQ96DT6 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATG4CQ96DT6 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATG4CQ96DT6 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATG4CQ96DT6 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATG4CQ96DT6 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATG4CQ96DT6 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATG4CQ96DT6 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATG4CQ96DT6 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATG4CQ96DT6 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATG4CQ96DT6 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATG4CQ96DT6 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATG4CQ96DT6 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATG4CQ96DT6 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATG4CQ96DT6 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATG4CQ96DT6 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATG4CQ96DT6 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATG4CQ96DT6 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATG4CQ96DT6 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATG4CQ96DT6 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATG4CQ96DT6 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATG4CQ96DT6 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATG4CQ96DT6 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATG4CQ96DT6 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATG4CQ96DT6 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ATG4CQ96DT6 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ATG4CQ96DT6 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ATG4CQ96DT6 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ATG4CQ96DT6 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
ATG4CQ96DT6 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ATG4CQ96DT6 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ATG4CQ96DT6 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ATG4CQ96DT6 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ATG4CQ96DT6 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ATG4CQ96DT6 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ATG4CQ96DT6 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ATG4CQ96DT6 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATG4CQ96DT6 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATG4CQ96DT6 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATG4CQ96DT6 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATG4CQ96DT6 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATG4CQ96DT6 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATG4CQ96DT6 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATG4CQ96DT6 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATG4CQ96DT6 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATG4CQ96DT6 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATG4CQ96DT6 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATG4CQ96DT6 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATG4CQ96DT6 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATG4CQ96DT6 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
ATG4CQ96DT6 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATG4CQ96DT6 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATG4CQ96DT6 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATG4CQ96DT6 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATG4CQ96DT6 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATG4CQ96DT6 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATG4CQ96DT6 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATG4CQ96DT6 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATG4CQ96DT6 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
ATG4CQ96DT6 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATG4CQ96DT6 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATG4CQ96DT6 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATG4CQ96DT6 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATG4CQ96DT6 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATG4CQ96DT6 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATG4CQ96DT6 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATG4CQ96DT6 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATG4CQ96DT6 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
ATG4CQ96DT6 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATG4CQ96DT6 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATG4CQ96DT6 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATG4CQ96DT6 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATG4CQ96DT6 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATG4CQ96DT6 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATG4CQ96DT6 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATG4CQ96DT6 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATG4CQ96DT6 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATG4CQ96DT6 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATG4CQ96DT6 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATG4CQ96DT6 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATG4CQ96DT6 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATG4CQ96DT6 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
ATG4CQ96DT6 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATG4CQ96DT6 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
ATG4CQ96DT6 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
ATG4CQ96DT6 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
ATG4CQ96DT6 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms