Protein–RNA interactions for Protein: Q96DC9

OTUB2, Ubiquitin thioesterase OTUB2, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUB2Q96DC9 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
OTUB2Q96DC9 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
OTUB2Q96DC9 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
OTUB2Q96DC9 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
OTUB2Q96DC9 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
OTUB2Q96DC9 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
OTUB2Q96DC9 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
OTUB2Q96DC9 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
OTUB2Q96DC9 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
OTUB2Q96DC9 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
OTUB2Q96DC9 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
OTUB2Q96DC9 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
OTUB2Q96DC9 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
OTUB2Q96DC9 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
OTUB2Q96DC9 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
OTUB2Q96DC9 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
OTUB2Q96DC9 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
OTUB2Q96DC9 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
OTUB2Q96DC9 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
OTUB2Q96DC9 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
OTUB2Q96DC9 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
OTUB2Q96DC9 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
OTUB2Q96DC9 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
OTUB2Q96DC9 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
OTUB2Q96DC9 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
OTUB2Q96DC9 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
OTUB2Q96DC9 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
OTUB2Q96DC9 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
OTUB2Q96DC9 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
OTUB2Q96DC9 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
OTUB2Q96DC9 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
OTUB2Q96DC9 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
OTUB2Q96DC9 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
OTUB2Q96DC9 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
OTUB2Q96DC9 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
OTUB2Q96DC9 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
OTUB2Q96DC9 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
OTUB2Q96DC9 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
OTUB2Q96DC9 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
OTUB2Q96DC9 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
OTUB2Q96DC9 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
OTUB2Q96DC9 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
OTUB2Q96DC9 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
OTUB2Q96DC9 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
OTUB2Q96DC9 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
OTUB2Q96DC9 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
OTUB2Q96DC9 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
OTUB2Q96DC9 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
OTUB2Q96DC9 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
OTUB2Q96DC9 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
OTUB2Q96DC9 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
OTUB2Q96DC9 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
OTUB2Q96DC9 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
OTUB2Q96DC9 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
OTUB2Q96DC9 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
OTUB2Q96DC9 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
OTUB2Q96DC9 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
OTUB2Q96DC9 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
OTUB2Q96DC9 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
OTUB2Q96DC9 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
OTUB2Q96DC9 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
OTUB2Q96DC9 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
OTUB2Q96DC9 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
OTUB2Q96DC9 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
OTUB2Q96DC9 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
OTUB2Q96DC9 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
OTUB2Q96DC9 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
OTUB2Q96DC9 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
OTUB2Q96DC9 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
OTUB2Q96DC9 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
OTUB2Q96DC9 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
OTUB2Q96DC9 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
OTUB2Q96DC9 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
OTUB2Q96DC9 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
OTUB2Q96DC9 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
OTUB2Q96DC9 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
OTUB2Q96DC9 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
OTUB2Q96DC9 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
OTUB2Q96DC9 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
OTUB2Q96DC9 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
OTUB2Q96DC9 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
OTUB2Q96DC9 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
OTUB2Q96DC9 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
OTUB2Q96DC9 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
OTUB2Q96DC9 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
OTUB2Q96DC9 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
OTUB2Q96DC9 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
OTUB2Q96DC9 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
OTUB2Q96DC9 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
OTUB2Q96DC9 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
OTUB2Q96DC9 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
OTUB2Q96DC9 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
OTUB2Q96DC9 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
OTUB2Q96DC9 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
OTUB2Q96DC9 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
OTUB2Q96DC9 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
OTUB2Q96DC9 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
OTUB2Q96DC9 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
OTUB2Q96DC9 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
OTUB2Q96DC9 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms