Protein–RNA interactions for Protein: Q96DB2

HDAC11, Histone deacetylase 11, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC11Q96DB2 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HDAC11Q96DB2 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HDAC11Q96DB2 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HDAC11Q96DB2 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HDAC11Q96DB2 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HDAC11Q96DB2 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HDAC11Q96DB2 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HDAC11Q96DB2 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HDAC11Q96DB2 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HDAC11Q96DB2 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
HDAC11Q96DB2 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HDAC11Q96DB2 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HDAC11Q96DB2 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HDAC11Q96DB2 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
HDAC11Q96DB2 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HDAC11Q96DB2 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HDAC11Q96DB2 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HDAC11Q96DB2 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HDAC11Q96DB2 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HDAC11Q96DB2 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HDAC11Q96DB2 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HDAC11Q96DB2 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
HDAC11Q96DB2 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
HDAC11Q96DB2 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HDAC11Q96DB2 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HDAC11Q96DB2 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HDAC11Q96DB2 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
HDAC11Q96DB2 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HDAC11Q96DB2 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HDAC11Q96DB2 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HDAC11Q96DB2 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HDAC11Q96DB2 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HDAC11Q96DB2 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HDAC11Q96DB2 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HDAC11Q96DB2 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HDAC11Q96DB2 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HDAC11Q96DB2 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HDAC11Q96DB2 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HDAC11Q96DB2 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HDAC11Q96DB2 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HDAC11Q96DB2 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HDAC11Q96DB2 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HDAC11Q96DB2 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HDAC11Q96DB2 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HDAC11Q96DB2 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HDAC11Q96DB2 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HDAC11Q96DB2 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HDAC11Q96DB2 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HDAC11Q96DB2 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HDAC11Q96DB2 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HDAC11Q96DB2 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HDAC11Q96DB2 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
HDAC11Q96DB2 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HDAC11Q96DB2 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HDAC11Q96DB2 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HDAC11Q96DB2 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HDAC11Q96DB2 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HDAC11Q96DB2 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HDAC11Q96DB2 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
HDAC11Q96DB2 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HDAC11Q96DB2 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
HDAC11Q96DB2 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HDAC11Q96DB2 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HDAC11Q96DB2 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HDAC11Q96DB2 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
HDAC11Q96DB2 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HDAC11Q96DB2 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HDAC11Q96DB2 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HDAC11Q96DB2 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HDAC11Q96DB2 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HDAC11Q96DB2 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
HDAC11Q96DB2 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HDAC11Q96DB2 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HDAC11Q96DB2 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HDAC11Q96DB2 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HDAC11Q96DB2 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
HDAC11Q96DB2 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
HDAC11Q96DB2 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HDAC11Q96DB2 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HDAC11Q96DB2 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HDAC11Q96DB2 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HDAC11Q96DB2 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HDAC11Q96DB2 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HDAC11Q96DB2 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HDAC11Q96DB2 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HDAC11Q96DB2 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
HDAC11Q96DB2 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HDAC11Q96DB2 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HDAC11Q96DB2 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HDAC11Q96DB2 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HDAC11Q96DB2 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HDAC11Q96DB2 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HDAC11Q96DB2 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HDAC11Q96DB2 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HDAC11Q96DB2 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HDAC11Q96DB2 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HDAC11Q96DB2 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HDAC11Q96DB2 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HDAC11Q96DB2 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HDAC11Q96DB2 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.4 ms