Protein–RNA interactions for Protein: Q96C34

RUNDC1, RUN domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC1Q96C34 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RUNDC1Q96C34 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
RUNDC1Q96C34 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RUNDC1Q96C34 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.24
RUNDC1Q96C34 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
RUNDC1Q96C34 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
RUNDC1Q96C34 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
RUNDC1Q96C34 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
RUNDC1Q96C34 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
RUNDC1Q96C34 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
RUNDC1Q96C34 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RUNDC1Q96C34 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
RUNDC1Q96C34 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RUNDC1Q96C34 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
RUNDC1Q96C34 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RUNDC1Q96C34 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
RUNDC1Q96C34 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RUNDC1Q96C34 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RUNDC1Q96C34 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RUNDC1Q96C34 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RUNDC1Q96C34 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RUNDC1Q96C34 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
RUNDC1Q96C34 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
RUNDC1Q96C34 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
RUNDC1Q96C34 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
RUNDC1Q96C34 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
RUNDC1Q96C34 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
RUNDC1Q96C34 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
RUNDC1Q96C34 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
RUNDC1Q96C34 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
RUNDC1Q96C34 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
RUNDC1Q96C34 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
RUNDC1Q96C34 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
RUNDC1Q96C34 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
RUNDC1Q96C34 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
RUNDC1Q96C34 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RUNDC1Q96C34 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RUNDC1Q96C34 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
RUNDC1Q96C34 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RUNDC1Q96C34 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RUNDC1Q96C34 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RUNDC1Q96C34 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RUNDC1Q96C34 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
RUNDC1Q96C34 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
RUNDC1Q96C34 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
RUNDC1Q96C34 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RUNDC1Q96C34 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
RUNDC1Q96C34 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
RUNDC1Q96C34 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
RUNDC1Q96C34 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
RUNDC1Q96C34 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RUNDC1Q96C34 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
RUNDC1Q96C34 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
RUNDC1Q96C34 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC29.01■■■□□ 2.24
RUNDC1Q96C34 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
RUNDC1Q96C34 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
RUNDC1Q96C34 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
RUNDC1Q96C34 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
RUNDC1Q96C34 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
RUNDC1Q96C34 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
RUNDC1Q96C34 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
RUNDC1Q96C34 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
RUNDC1Q96C34 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
RUNDC1Q96C34 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
RUNDC1Q96C34 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
RUNDC1Q96C34 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
RUNDC1Q96C34 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
RUNDC1Q96C34 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
RUNDC1Q96C34 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
RUNDC1Q96C34 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
RUNDC1Q96C34 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
RUNDC1Q96C34 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC29■■■□□ 2.23
RUNDC1Q96C34 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
RUNDC1Q96C34 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
RUNDC1Q96C34 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
RUNDC1Q96C34 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
RUNDC1Q96C34 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RUNDC1Q96C34 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RUNDC1Q96C34 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RUNDC1Q96C34 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
RUNDC1Q96C34 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
RUNDC1Q96C34 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
RUNDC1Q96C34 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
RUNDC1Q96C34 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
RUNDC1Q96C34 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RUNDC1Q96C34 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
RUNDC1Q96C34 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
RUNDC1Q96C34 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
RUNDC1Q96C34 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
RUNDC1Q96C34 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
RUNDC1Q96C34 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
RUNDC1Q96C34 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
RUNDC1Q96C34 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
RUNDC1Q96C34 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
RUNDC1Q96C34 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
RUNDC1Q96C34 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
RUNDC1Q96C34 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
RUNDC1Q96C34 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
RUNDC1Q96C34 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
RUNDC1Q96C34 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.7 ms