Protein–RNA interactions for Protein: Q96AW1

VOPP1, Vesicular, overexpressed in cancer, prosurvival protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VOPP1Q96AW1 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VOPP1Q96AW1 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VOPP1Q96AW1 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VOPP1Q96AW1 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VOPP1Q96AW1 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VOPP1Q96AW1 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VOPP1Q96AW1 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
VOPP1Q96AW1 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
VOPP1Q96AW1 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
VOPP1Q96AW1 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
VOPP1Q96AW1 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VOPP1Q96AW1 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VOPP1Q96AW1 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VOPP1Q96AW1 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VOPP1Q96AW1 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VOPP1Q96AW1 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VOPP1Q96AW1 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VOPP1Q96AW1 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VOPP1Q96AW1 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VOPP1Q96AW1 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VOPP1Q96AW1 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VOPP1Q96AW1 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VOPP1Q96AW1 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VOPP1Q96AW1 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VOPP1Q96AW1 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
VOPP1Q96AW1 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VOPP1Q96AW1 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VOPP1Q96AW1 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VOPP1Q96AW1 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VOPP1Q96AW1 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VOPP1Q96AW1 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VOPP1Q96AW1 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VOPP1Q96AW1 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VOPP1Q96AW1 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VOPP1Q96AW1 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VOPP1Q96AW1 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VOPP1Q96AW1 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VOPP1Q96AW1 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VOPP1Q96AW1 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VOPP1Q96AW1 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VOPP1Q96AW1 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VOPP1Q96AW1 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VOPP1Q96AW1 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VOPP1Q96AW1 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VOPP1Q96AW1 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VOPP1Q96AW1 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VOPP1Q96AW1 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VOPP1Q96AW1 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VOPP1Q96AW1 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VOPP1Q96AW1 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VOPP1Q96AW1 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VOPP1Q96AW1 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VOPP1Q96AW1 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VOPP1Q96AW1 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VOPP1Q96AW1 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VOPP1Q96AW1 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VOPP1Q96AW1 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VOPP1Q96AW1 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VOPP1Q96AW1 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VOPP1Q96AW1 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
VOPP1Q96AW1 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VOPP1Q96AW1 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VOPP1Q96AW1 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VOPP1Q96AW1 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VOPP1Q96AW1 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
VOPP1Q96AW1 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VOPP1Q96AW1 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VOPP1Q96AW1 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VOPP1Q96AW1 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VOPP1Q96AW1 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VOPP1Q96AW1 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VOPP1Q96AW1 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VOPP1Q96AW1 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
VOPP1Q96AW1 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VOPP1Q96AW1 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
VOPP1Q96AW1 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VOPP1Q96AW1 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VOPP1Q96AW1 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VOPP1Q96AW1 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
VOPP1Q96AW1 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
VOPP1Q96AW1 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
VOPP1Q96AW1 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VOPP1Q96AW1 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VOPP1Q96AW1 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VOPP1Q96AW1 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VOPP1Q96AW1 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VOPP1Q96AW1 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VOPP1Q96AW1 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VOPP1Q96AW1 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VOPP1Q96AW1 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VOPP1Q96AW1 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VOPP1Q96AW1 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VOPP1Q96AW1 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VOPP1Q96AW1 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VOPP1Q96AW1 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VOPP1Q96AW1 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VOPP1Q96AW1 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VOPP1Q96AW1 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
VOPP1Q96AW1 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VOPP1Q96AW1 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms