Protein–RNA interactions for Protein: Q969V6

MKL1, MKL/myocardin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 931 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKL1Q969V6 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MKL1Q969V6 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MKL1Q969V6 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MKL1Q969V6 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MKL1Q969V6 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MKL1Q969V6 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MKL1Q969V6 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MKL1Q969V6 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
MKL1Q969V6 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MKL1Q969V6 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MKL1Q969V6 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MKL1Q969V6 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MKL1Q969V6 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MKL1Q969V6 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MKL1Q969V6 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MKL1Q969V6 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MKL1Q969V6 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MKL1Q969V6 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MKL1Q969V6 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MKL1Q969V6 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MKL1Q969V6 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MKL1Q969V6 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MKL1Q969V6 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MKL1Q969V6 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MKL1Q969V6 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MKL1Q969V6 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MKL1Q969V6 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MKL1Q969V6 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MKL1Q969V6 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
MKL1Q969V6 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MKL1Q969V6 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MKL1Q969V6 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MKL1Q969V6 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MKL1Q969V6 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MKL1Q969V6 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MKL1Q969V6 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MKL1Q969V6 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MKL1Q969V6 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MKL1Q969V6 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MKL1Q969V6 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MKL1Q969V6 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MKL1Q969V6 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MKL1Q969V6 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MKL1Q969V6 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MKL1Q969V6 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MKL1Q969V6 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MKL1Q969V6 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MKL1Q969V6 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
MKL1Q969V6 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MKL1Q969V6 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MKL1Q969V6 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
MKL1Q969V6 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
MKL1Q969V6 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MKL1Q969V6 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MKL1Q969V6 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MKL1Q969V6 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
MKL1Q969V6 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
MKL1Q969V6 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MKL1Q969V6 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
MKL1Q969V6 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MKL1Q969V6 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
MKL1Q969V6 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
MKL1Q969V6 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
MKL1Q969V6 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MKL1Q969V6 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MKL1Q969V6 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MKL1Q969V6 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MKL1Q969V6 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MKL1Q969V6 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
MKL1Q969V6 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MKL1Q969V6 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MKL1Q969V6 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MKL1Q969V6 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MKL1Q969V6 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MKL1Q969V6 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MKL1Q969V6 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MKL1Q969V6 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
MKL1Q969V6 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MKL1Q969V6 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MKL1Q969V6 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MKL1Q969V6 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MKL1Q969V6 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MKL1Q969V6 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MKL1Q969V6 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MKL1Q969V6 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MKL1Q969V6 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MKL1Q969V6 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MKL1Q969V6 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MKL1Q969V6 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
MKL1Q969V6 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MKL1Q969V6 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MKL1Q969V6 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MKL1Q969V6 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MKL1Q969V6 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MKL1Q969V6 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MKL1Q969V6 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MKL1Q969V6 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
MKL1Q969V6 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MKL1Q969V6 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MKL1Q969V6 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms