Protein–RNA interactions for Protein: Q969T4

UBE2E3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E3Q969T4 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
UBE2E3Q969T4 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
UBE2E3Q969T4 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
UBE2E3Q969T4 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
UBE2E3Q969T4 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
UBE2E3Q969T4 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
UBE2E3Q969T4 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
UBE2E3Q969T4 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
UBE2E3Q969T4 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
UBE2E3Q969T4 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
UBE2E3Q969T4 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
UBE2E3Q969T4 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
UBE2E3Q969T4 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
UBE2E3Q969T4 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
UBE2E3Q969T4 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
UBE2E3Q969T4 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
UBE2E3Q969T4 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
UBE2E3Q969T4 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
UBE2E3Q969T4 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
UBE2E3Q969T4 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
UBE2E3Q969T4 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
UBE2E3Q969T4 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
UBE2E3Q969T4 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
UBE2E3Q969T4 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
UBE2E3Q969T4 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
UBE2E3Q969T4 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
UBE2E3Q969T4 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
UBE2E3Q969T4 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
UBE2E3Q969T4 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
UBE2E3Q969T4 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
UBE2E3Q969T4 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
UBE2E3Q969T4 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
UBE2E3Q969T4 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
UBE2E3Q969T4 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
UBE2E3Q969T4 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
UBE2E3Q969T4 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
UBE2E3Q969T4 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
UBE2E3Q969T4 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
UBE2E3Q969T4 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
UBE2E3Q969T4 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
UBE2E3Q969T4 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
UBE2E3Q969T4 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
UBE2E3Q969T4 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
UBE2E3Q969T4 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
UBE2E3Q969T4 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
UBE2E3Q969T4 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
UBE2E3Q969T4 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
UBE2E3Q969T4 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
UBE2E3Q969T4 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
UBE2E3Q969T4 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
UBE2E3Q969T4 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
UBE2E3Q969T4 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
UBE2E3Q969T4 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
UBE2E3Q969T4 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
UBE2E3Q969T4 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
UBE2E3Q969T4 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
UBE2E3Q969T4 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
UBE2E3Q969T4 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
UBE2E3Q969T4 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
UBE2E3Q969T4 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
UBE2E3Q969T4 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
UBE2E3Q969T4 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
UBE2E3Q969T4 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
UBE2E3Q969T4 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
UBE2E3Q969T4 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
UBE2E3Q969T4 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
UBE2E3Q969T4 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
UBE2E3Q969T4 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
UBE2E3Q969T4 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
UBE2E3Q969T4 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
UBE2E3Q969T4 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
UBE2E3Q969T4 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
UBE2E3Q969T4 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
UBE2E3Q969T4 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
UBE2E3Q969T4 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
UBE2E3Q969T4 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
UBE2E3Q969T4 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
UBE2E3Q969T4 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
UBE2E3Q969T4 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
UBE2E3Q969T4 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
UBE2E3Q969T4 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
UBE2E3Q969T4 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
UBE2E3Q969T4 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
UBE2E3Q969T4 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
UBE2E3Q969T4 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
UBE2E3Q969T4 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
UBE2E3Q969T4 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
UBE2E3Q969T4 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
UBE2E3Q969T4 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
UBE2E3Q969T4 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
UBE2E3Q969T4 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
UBE2E3Q969T4 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
UBE2E3Q969T4 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
UBE2E3Q969T4 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
UBE2E3Q969T4 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
UBE2E3Q969T4 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
UBE2E3Q969T4 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
UBE2E3Q969T4 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
UBE2E3Q969T4 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
UBE2E3Q969T4 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms