Protein–RNA interactions for Protein: Q969T3

SNX21, Sorting nexin-21, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX21Q969T3 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SNX21Q969T3 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SNX21Q969T3 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SNX21Q969T3 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SNX21Q969T3 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
SNX21Q969T3 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
SNX21Q969T3 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SNX21Q969T3 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
SNX21Q969T3 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
SNX21Q969T3 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
SNX21Q969T3 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SNX21Q969T3 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SNX21Q969T3 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SNX21Q969T3 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SNX21Q969T3 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SNX21Q969T3 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SNX21Q969T3 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SNX21Q969T3 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SNX21Q969T3 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SNX21Q969T3 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SNX21Q969T3 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SNX21Q969T3 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SNX21Q969T3 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SNX21Q969T3 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SNX21Q969T3 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SNX21Q969T3 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SNX21Q969T3 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SNX21Q969T3 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SNX21Q969T3 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SNX21Q969T3 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SNX21Q969T3 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
SNX21Q969T3 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SNX21Q969T3 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
SNX21Q969T3 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SNX21Q969T3 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SNX21Q969T3 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SNX21Q969T3 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SNX21Q969T3 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SNX21Q969T3 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SNX21Q969T3 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SNX21Q969T3 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SNX21Q969T3 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
SNX21Q969T3 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SNX21Q969T3 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SNX21Q969T3 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SNX21Q969T3 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
SNX21Q969T3 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SNX21Q969T3 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
SNX21Q969T3 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SNX21Q969T3 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SNX21Q969T3 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
SNX21Q969T3 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SNX21Q969T3 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SNX21Q969T3 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SNX21Q969T3 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SNX21Q969T3 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SNX21Q969T3 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SNX21Q969T3 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SNX21Q969T3 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SNX21Q969T3 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SNX21Q969T3 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SNX21Q969T3 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SNX21Q969T3 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SNX21Q969T3 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SNX21Q969T3 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SNX21Q969T3 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SNX21Q969T3 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SNX21Q969T3 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SNX21Q969T3 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SNX21Q969T3 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SNX21Q969T3 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
SNX21Q969T3 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SNX21Q969T3 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SNX21Q969T3 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SNX21Q969T3 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
SNX21Q969T3 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
SNX21Q969T3 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SNX21Q969T3 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SNX21Q969T3 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SNX21Q969T3 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SNX21Q969T3 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
SNX21Q969T3 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SNX21Q969T3 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SNX21Q969T3 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SNX21Q969T3 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SNX21Q969T3 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SNX21Q969T3 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SNX21Q969T3 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SNX21Q969T3 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SNX21Q969T3 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SNX21Q969T3 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SNX21Q969T3 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SNX21Q969T3 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SNX21Q969T3 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SNX21Q969T3 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SNX21Q969T3 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SNX21Q969T3 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SNX21Q969T3 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SNX21Q969T3 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SNX21Q969T3 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.6 ms