Protein–RNA interactions for Protein: Q969K3

RNF34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF34Q969K3 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RNF34Q969K3 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RNF34Q969K3 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF34Q969K3 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF34Q969K3 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF34Q969K3 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF34Q969K3 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF34Q969K3 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF34Q969K3 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF34Q969K3 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF34Q969K3 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF34Q969K3 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF34Q969K3 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF34Q969K3 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF34Q969K3 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF34Q969K3 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF34Q969K3 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF34Q969K3 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF34Q969K3 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF34Q969K3 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF34Q969K3 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF34Q969K3 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF34Q969K3 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF34Q969K3 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF34Q969K3 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF34Q969K3 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF34Q969K3 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF34Q969K3 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF34Q969K3 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF34Q969K3 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF34Q969K3 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF34Q969K3 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF34Q969K3 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF34Q969K3 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF34Q969K3 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF34Q969K3 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF34Q969K3 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF34Q969K3 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF34Q969K3 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF34Q969K3 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF34Q969K3 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RNF34Q969K3 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RNF34Q969K3 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RNF34Q969K3 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
RNF34Q969K3 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RNF34Q969K3 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RNF34Q969K3 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RNF34Q969K3 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RNF34Q969K3 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RNF34Q969K3 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RNF34Q969K3 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RNF34Q969K3 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RNF34Q969K3 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RNF34Q969K3 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RNF34Q969K3 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RNF34Q969K3 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RNF34Q969K3 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RNF34Q969K3 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RNF34Q969K3 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
RNF34Q969K3 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
RNF34Q969K3 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RNF34Q969K3 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
RNF34Q969K3 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
RNF34Q969K3 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RNF34Q969K3 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RNF34Q969K3 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RNF34Q969K3 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RNF34Q969K3 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RNF34Q969K3 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RNF34Q969K3 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RNF34Q969K3 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RNF34Q969K3 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RNF34Q969K3 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RNF34Q969K3 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RNF34Q969K3 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RNF34Q969K3 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RNF34Q969K3 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RNF34Q969K3 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
RNF34Q969K3 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RNF34Q969K3 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RNF34Q969K3 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RNF34Q969K3 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RNF34Q969K3 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RNF34Q969K3 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RNF34Q969K3 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RNF34Q969K3 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RNF34Q969K3 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RNF34Q969K3 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RNF34Q969K3 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RNF34Q969K3 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RNF34Q969K3 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RNF34Q969K3 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RNF34Q969K3 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RNF34Q969K3 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
RNF34Q969K3 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RNF34Q969K3 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RNF34Q969K3 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RNF34Q969K3 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RNF34Q969K3 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RNF34Q969K3 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms