Protein–RNA interactions for Protein: Q92954

PRG4, Proteoglycan 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG4Q92954 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
PRG4Q92954 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
PRG4Q92954 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC35.57■■■■□ 3.29
PRG4Q92954 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC35.57■■■■□ 3.29
PRG4Q92954 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC35.57■■■■□ 3.29
PRG4Q92954 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC35.57■■■■□ 3.29
PRG4Q92954 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
PRG4Q92954 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
PRG4Q92954 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC35.57■■■■□ 3.28
PRG4Q92954 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC35.57■■■■□ 3.28
PRG4Q92954 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC35.57■■■■□ 3.28
PRG4Q92954 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC35.56■■■■□ 3.28
PRG4Q92954 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.56■■■■□ 3.28
PRG4Q92954 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.56■■■■□ 3.28
PRG4Q92954 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.56■■■■□ 3.28
PRG4Q92954 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
PRG4Q92954 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC35.55■■■■□ 3.28
PRG4Q92954 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC35.55■■■■□ 3.28
PRG4Q92954 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
PRG4Q92954 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.55■■■■□ 3.28
PRG4Q92954 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.55■■■■□ 3.28
PRG4Q92954 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC35.55■■■■□ 3.28
PRG4Q92954 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.55■■■■□ 3.28
PRG4Q92954 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC35.55■■■■□ 3.28
PRG4Q92954 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.55■■■■□ 3.28
PRG4Q92954 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC35.55■■■■□ 3.28
PRG4Q92954 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
PRG4Q92954 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
PRG4Q92954 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC35.54■■■■□ 3.28
PRG4Q92954 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC35.54■■■■□ 3.28
PRG4Q92954 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
PRG4Q92954 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC35.54■■■■□ 3.28
PRG4Q92954 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
PRG4Q92954 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
PRG4Q92954 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
PRG4Q92954 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC35.53■■■■□ 3.28
PRG4Q92954 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
PRG4Q92954 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC35.53■■■■□ 3.28
PRG4Q92954 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
PRG4Q92954 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC35.53■■■■□ 3.28
PRG4Q92954 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC35.53■■■■□ 3.28
PRG4Q92954 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC35.53■■■■□ 3.28
PRG4Q92954 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
PRG4Q92954 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
PRG4Q92954 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
PRG4Q92954 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
PRG4Q92954 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
PRG4Q92954 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC35.52■■■■□ 3.28
PRG4Q92954 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC35.52■■■■□ 3.28
PRG4Q92954 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
PRG4Q92954 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC35.51■■■■□ 3.28
PRG4Q92954 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC35.51■■■■□ 3.28
PRG4Q92954 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC35.51■■■■□ 3.28
PRG4Q92954 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC35.51■■■■□ 3.28
PRG4Q92954 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC35.51■■■■□ 3.28
PRG4Q92954 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
PRG4Q92954 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC35.51■■■■□ 3.27
PRG4Q92954 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
PRG4Q92954 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
PRG4Q92954 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
PRG4Q92954 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC35.5■■■■□ 3.27
PRG4Q92954 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC35.5■■■■□ 3.27
PRG4Q92954 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
PRG4Q92954 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
PRG4Q92954 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
PRG4Q92954 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC35.49■■■■□ 3.27
PRG4Q92954 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.49■■■■□ 3.27
PRG4Q92954 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
PRG4Q92954 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.49■■■■□ 3.27
PRG4Q92954 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC35.49■■■■□ 3.27
PRG4Q92954 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
PRG4Q92954 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.49■■■■□ 3.27
PRG4Q92954 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
PRG4Q92954 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
PRG4Q92954 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.48■■■■□ 3.27
PRG4Q92954 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
PRG4Q92954 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
PRG4Q92954 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC35.48■■■■□ 3.27
PRG4Q92954 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC35.48■■■■□ 3.27
PRG4Q92954 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC35.48■■■■□ 3.27
PRG4Q92954 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC35.48■■■■□ 3.27
PRG4Q92954 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC35.48■■■■□ 3.27
PRG4Q92954 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC35.47■■■■□ 3.27
PRG4Q92954 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
PRG4Q92954 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
PRG4Q92954 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC35.47■■■■□ 3.27
PRG4Q92954 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC35.46■■■■□ 3.27
PRG4Q92954 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC35.46■■■■□ 3.27
PRG4Q92954 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.46■■■■□ 3.27
PRG4Q92954 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC35.46■■■■□ 3.27
PRG4Q92954 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC35.46■■■■□ 3.27
PRG4Q92954 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC35.46■■■■□ 3.27
PRG4Q92954 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
PRG4Q92954 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC35.45■■■■□ 3.27
PRG4Q92954 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
PRG4Q92954 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
PRG4Q92954 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC35.44■■■■□ 3.26
PRG4Q92954 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
PRG4Q92954 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.43■■■■□ 3.26
PRG4Q92954 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms