Protein–RNA interactions for Protein: Q92878

RAD50, DNA repair protein RAD50, humanhuman

Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD50Q92878 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RAD50Q92878 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RAD50Q92878 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RAD50Q92878 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
RAD50Q92878 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RAD50Q92878 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RAD50Q92878 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RAD50Q92878 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RAD50Q92878 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RAD50Q92878 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RAD50Q92878 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RAD50Q92878 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
RAD50Q92878 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RAD50Q92878 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RAD50Q92878 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RAD50Q92878 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
RAD50Q92878 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RAD50Q92878 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RAD50Q92878 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RAD50Q92878 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
RAD50Q92878 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RAD50Q92878 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RAD50Q92878 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RAD50Q92878 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RAD50Q92878 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RAD50Q92878 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RAD50Q92878 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RAD50Q92878 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RAD50Q92878 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
RAD50Q92878 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
RAD50Q92878 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RAD50Q92878 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RAD50Q92878 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RAD50Q92878 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RAD50Q92878 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RAD50Q92878 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RAD50Q92878 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RAD50Q92878 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RAD50Q92878 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RAD50Q92878 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
RAD50Q92878 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
RAD50Q92878 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RAD50Q92878 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RAD50Q92878 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RAD50Q92878 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RAD50Q92878 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RAD50Q92878 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RAD50Q92878 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
RAD50Q92878 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
RAD50Q92878 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
RAD50Q92878 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
RAD50Q92878 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
RAD50Q92878 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
RAD50Q92878 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
RAD50Q92878 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
RAD50Q92878 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
RAD50Q92878 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
RAD50Q92878 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
RAD50Q92878 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
RAD50Q92878 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
RAD50Q92878 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RAD50Q92878 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RAD50Q92878 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
RAD50Q92878 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RAD50Q92878 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RAD50Q92878 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RAD50Q92878 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RAD50Q92878 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RAD50Q92878 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RAD50Q92878 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RAD50Q92878 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RAD50Q92878 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RAD50Q92878 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RAD50Q92878 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RAD50Q92878 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RAD50Q92878 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RAD50Q92878 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RAD50Q92878 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RAD50Q92878 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RAD50Q92878 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
RAD50Q92878 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RAD50Q92878 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RAD50Q92878 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RAD50Q92878 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RAD50Q92878 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
RAD50Q92878 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RAD50Q92878 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RAD50Q92878 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RAD50Q92878 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RAD50Q92878 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RAD50Q92878 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RAD50Q92878 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RAD50Q92878 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RAD50Q92878 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RAD50Q92878 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RAD50Q92878 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
RAD50Q92878 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
RAD50Q92878 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RAD50Q92878 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
RAD50Q92878 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms