Protein–RNA interactions for Protein: Q92854

SEMA4D, Semaphorin-4D, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4DQ92854 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SEMA4DQ92854 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SEMA4DQ92854 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SEMA4DQ92854 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SEMA4DQ92854 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SEMA4DQ92854 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SEMA4DQ92854 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SEMA4DQ92854 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SEMA4DQ92854 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SEMA4DQ92854 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SEMA4DQ92854 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SEMA4DQ92854 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SEMA4DQ92854 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SEMA4DQ92854 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SEMA4DQ92854 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SEMA4DQ92854 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SEMA4DQ92854 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SEMA4DQ92854 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SEMA4DQ92854 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SEMA4DQ92854 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SEMA4DQ92854 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SEMA4DQ92854 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SEMA4DQ92854 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SEMA4DQ92854 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SEMA4DQ92854 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SEMA4DQ92854 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SEMA4DQ92854 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SEMA4DQ92854 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SEMA4DQ92854 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SEMA4DQ92854 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SEMA4DQ92854 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SEMA4DQ92854 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SEMA4DQ92854 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SEMA4DQ92854 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SEMA4DQ92854 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SEMA4DQ92854 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SEMA4DQ92854 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SEMA4DQ92854 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SEMA4DQ92854 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SEMA4DQ92854 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SEMA4DQ92854 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SEMA4DQ92854 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SEMA4DQ92854 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SEMA4DQ92854 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SEMA4DQ92854 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SEMA4DQ92854 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SEMA4DQ92854 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SEMA4DQ92854 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SEMA4DQ92854 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SEMA4DQ92854 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SEMA4DQ92854 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SEMA4DQ92854 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SEMA4DQ92854 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SEMA4DQ92854 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SEMA4DQ92854 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SEMA4DQ92854 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SEMA4DQ92854 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SEMA4DQ92854 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SEMA4DQ92854 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SEMA4DQ92854 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SEMA4DQ92854 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SEMA4DQ92854 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SEMA4DQ92854 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SEMA4DQ92854 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SEMA4DQ92854 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SEMA4DQ92854 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SEMA4DQ92854 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SEMA4DQ92854 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SEMA4DQ92854 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SEMA4DQ92854 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SEMA4DQ92854 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SEMA4DQ92854 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SEMA4DQ92854 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SEMA4DQ92854 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SEMA4DQ92854 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SEMA4DQ92854 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SEMA4DQ92854 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SEMA4DQ92854 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SEMA4DQ92854 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SEMA4DQ92854 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SEMA4DQ92854 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SEMA4DQ92854 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SEMA4DQ92854 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SEMA4DQ92854 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SEMA4DQ92854 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SEMA4DQ92854 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SEMA4DQ92854 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SEMA4DQ92854 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SEMA4DQ92854 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SEMA4DQ92854 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SEMA4DQ92854 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SEMA4DQ92854 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SEMA4DQ92854 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SEMA4DQ92854 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SEMA4DQ92854 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SEMA4DQ92854 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SEMA4DQ92854 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SEMA4DQ92854 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SEMA4DQ92854 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SEMA4DQ92854 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms