Protein–RNA interactions for Protein: Q92838

EDA, Ectodysplasin-A, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDAQ92838 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EDAQ92838 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EDAQ92838 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EDAQ92838 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EDAQ92838 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EDAQ92838 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EDAQ92838 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EDAQ92838 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EDAQ92838 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EDAQ92838 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EDAQ92838 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
EDAQ92838 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
EDAQ92838 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
EDAQ92838 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
EDAQ92838 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EDAQ92838 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
EDAQ92838 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
EDAQ92838 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EDAQ92838 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
EDAQ92838 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
EDAQ92838 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
EDAQ92838 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
EDAQ92838 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EDAQ92838 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EDAQ92838 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EDAQ92838 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EDAQ92838 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EDAQ92838 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EDAQ92838 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EDAQ92838 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EDAQ92838 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EDAQ92838 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EDAQ92838 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EDAQ92838 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EDAQ92838 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EDAQ92838 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EDAQ92838 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EDAQ92838 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EDAQ92838 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EDAQ92838 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EDAQ92838 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EDAQ92838 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EDAQ92838 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EDAQ92838 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EDAQ92838 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EDAQ92838 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EDAQ92838 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EDAQ92838 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EDAQ92838 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EDAQ92838 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
EDAQ92838 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EDAQ92838 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
EDAQ92838 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EDAQ92838 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
EDAQ92838 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EDAQ92838 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
EDAQ92838 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EDAQ92838 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EDAQ92838 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EDAQ92838 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EDAQ92838 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EDAQ92838 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EDAQ92838 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EDAQ92838 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EDAQ92838 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EDAQ92838 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EDAQ92838 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EDAQ92838 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EDAQ92838 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EDAQ92838 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
EDAQ92838 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EDAQ92838 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EDAQ92838 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EDAQ92838 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EDAQ92838 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EDAQ92838 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EDAQ92838 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EDAQ92838 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EDAQ92838 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EDAQ92838 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EDAQ92838 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EDAQ92838 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EDAQ92838 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EDAQ92838 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
EDAQ92838 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
EDAQ92838 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EDAQ92838 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EDAQ92838 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EDAQ92838 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EDAQ92838 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EDAQ92838 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EDAQ92838 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EDAQ92838 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
EDAQ92838 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EDAQ92838 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
EDAQ92838 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EDAQ92838 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EDAQ92838 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EDAQ92838 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EDAQ92838 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms