Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXF7

ATL1, Atlastin-1, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL1Q8WXF7 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATL1Q8WXF7 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATL1Q8WXF7 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATL1Q8WXF7 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATL1Q8WXF7 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATL1Q8WXF7 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ATL1Q8WXF7 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ATL1Q8WXF7 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATL1Q8WXF7 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATL1Q8WXF7 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATL1Q8WXF7 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATL1Q8WXF7 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATL1Q8WXF7 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATL1Q8WXF7 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATL1Q8WXF7 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATL1Q8WXF7 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATL1Q8WXF7 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATL1Q8WXF7 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATL1Q8WXF7 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATL1Q8WXF7 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATL1Q8WXF7 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATL1Q8WXF7 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATL1Q8WXF7 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATL1Q8WXF7 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATL1Q8WXF7 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATL1Q8WXF7 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATL1Q8WXF7 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATL1Q8WXF7 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATL1Q8WXF7 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATL1Q8WXF7 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATL1Q8WXF7 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATL1Q8WXF7 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATL1Q8WXF7 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATL1Q8WXF7 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATL1Q8WXF7 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATL1Q8WXF7 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATL1Q8WXF7 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ATL1Q8WXF7 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATL1Q8WXF7 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ATL1Q8WXF7 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATL1Q8WXF7 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATL1Q8WXF7 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATL1Q8WXF7 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ATL1Q8WXF7 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
ATL1Q8WXF7 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ATL1Q8WXF7 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ATL1Q8WXF7 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATL1Q8WXF7 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATL1Q8WXF7 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATL1Q8WXF7 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATL1Q8WXF7 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ATL1Q8WXF7 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATL1Q8WXF7 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATL1Q8WXF7 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATL1Q8WXF7 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATL1Q8WXF7 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATL1Q8WXF7 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATL1Q8WXF7 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATL1Q8WXF7 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATL1Q8WXF7 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATL1Q8WXF7 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATL1Q8WXF7 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATL1Q8WXF7 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATL1Q8WXF7 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATL1Q8WXF7 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATL1Q8WXF7 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATL1Q8WXF7 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATL1Q8WXF7 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATL1Q8WXF7 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATL1Q8WXF7 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ATL1Q8WXF7 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATL1Q8WXF7 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATL1Q8WXF7 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATL1Q8WXF7 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATL1Q8WXF7 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATL1Q8WXF7 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ATL1Q8WXF7 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATL1Q8WXF7 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATL1Q8WXF7 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATL1Q8WXF7 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATL1Q8WXF7 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATL1Q8WXF7 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATL1Q8WXF7 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATL1Q8WXF7 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATL1Q8WXF7 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATL1Q8WXF7 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATL1Q8WXF7 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATL1Q8WXF7 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATL1Q8WXF7 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATL1Q8WXF7 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATL1Q8WXF7 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATL1Q8WXF7 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATL1Q8WXF7 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATL1Q8WXF7 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATL1Q8WXF7 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATL1Q8WXF7 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATL1Q8WXF7 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATL1Q8WXF7 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATL1Q8WXF7 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ATL1Q8WXF7 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms