Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWL2

SPIRE2, Protein spire homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 714 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIRE2Q8WWL2 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPIRE2Q8WWL2 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPIRE2Q8WWL2 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPIRE2Q8WWL2 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPIRE2Q8WWL2 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPIRE2Q8WWL2 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPIRE2Q8WWL2 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPIRE2Q8WWL2 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPIRE2Q8WWL2 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPIRE2Q8WWL2 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPIRE2Q8WWL2 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPIRE2Q8WWL2 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPIRE2Q8WWL2 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPIRE2Q8WWL2 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPIRE2Q8WWL2 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPIRE2Q8WWL2 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPIRE2Q8WWL2 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPIRE2Q8WWL2 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SPIRE2Q8WWL2 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPIRE2Q8WWL2 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPIRE2Q8WWL2 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPIRE2Q8WWL2 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPIRE2Q8WWL2 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPIRE2Q8WWL2 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPIRE2Q8WWL2 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPIRE2Q8WWL2 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPIRE2Q8WWL2 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPIRE2Q8WWL2 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPIRE2Q8WWL2 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPIRE2Q8WWL2 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPIRE2Q8WWL2 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPIRE2Q8WWL2 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPIRE2Q8WWL2 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPIRE2Q8WWL2 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPIRE2Q8WWL2 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPIRE2Q8WWL2 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPIRE2Q8WWL2 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SPIRE2Q8WWL2 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPIRE2Q8WWL2 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPIRE2Q8WWL2 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPIRE2Q8WWL2 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPIRE2Q8WWL2 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPIRE2Q8WWL2 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPIRE2Q8WWL2 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPIRE2Q8WWL2 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPIRE2Q8WWL2 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPIRE2Q8WWL2 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPIRE2Q8WWL2 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPIRE2Q8WWL2 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SPIRE2Q8WWL2 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SPIRE2Q8WWL2 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SPIRE2Q8WWL2 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SPIRE2Q8WWL2 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SPIRE2Q8WWL2 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SPIRE2Q8WWL2 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SPIRE2Q8WWL2 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SPIRE2Q8WWL2 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SPIRE2Q8WWL2 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SPIRE2Q8WWL2 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SPIRE2Q8WWL2 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SPIRE2Q8WWL2 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SPIRE2Q8WWL2 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SPIRE2Q8WWL2 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPIRE2Q8WWL2 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPIRE2Q8WWL2 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPIRE2Q8WWL2 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPIRE2Q8WWL2 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPIRE2Q8WWL2 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPIRE2Q8WWL2 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPIRE2Q8WWL2 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPIRE2Q8WWL2 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPIRE2Q8WWL2 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPIRE2Q8WWL2 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SPIRE2Q8WWL2 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPIRE2Q8WWL2 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPIRE2Q8WWL2 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPIRE2Q8WWL2 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPIRE2Q8WWL2 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPIRE2Q8WWL2 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPIRE2Q8WWL2 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPIRE2Q8WWL2 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPIRE2Q8WWL2 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPIRE2Q8WWL2 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPIRE2Q8WWL2 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPIRE2Q8WWL2 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPIRE2Q8WWL2 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPIRE2Q8WWL2 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPIRE2Q8WWL2 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPIRE2Q8WWL2 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPIRE2Q8WWL2 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SPIRE2Q8WWL2 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPIRE2Q8WWL2 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPIRE2Q8WWL2 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPIRE2Q8WWL2 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SPIRE2Q8WWL2 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SPIRE2Q8WWL2 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SPIRE2Q8WWL2 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPIRE2Q8WWL2 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPIRE2Q8WWL2 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPIRE2Q8WWL2 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms