Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWI1

LMO7, LIM domain only protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,683 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO7Q8WWI1 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
LMO7Q8WWI1 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
LMO7Q8WWI1 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
LMO7Q8WWI1 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
LMO7Q8WWI1 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
LMO7Q8WWI1 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
LMO7Q8WWI1 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
LMO7Q8WWI1 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
LMO7Q8WWI1 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
LMO7Q8WWI1 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
LMO7Q8WWI1 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
LMO7Q8WWI1 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
LMO7Q8WWI1 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC29.61■■■□□ 2.33
LMO7Q8WWI1 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
LMO7Q8WWI1 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
LMO7Q8WWI1 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
LMO7Q8WWI1 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
LMO7Q8WWI1 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
LMO7Q8WWI1 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
LMO7Q8WWI1 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
LMO7Q8WWI1 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
LMO7Q8WWI1 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
LMO7Q8WWI1 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
LMO7Q8WWI1 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
LMO7Q8WWI1 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
LMO7Q8WWI1 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
LMO7Q8WWI1 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
LMO7Q8WWI1 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
LMO7Q8WWI1 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
LMO7Q8WWI1 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
LMO7Q8WWI1 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
LMO7Q8WWI1 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
LMO7Q8WWI1 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
LMO7Q8WWI1 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
LMO7Q8WWI1 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
LMO7Q8WWI1 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
LMO7Q8WWI1 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
LMO7Q8WWI1 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
LMO7Q8WWI1 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
LMO7Q8WWI1 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
LMO7Q8WWI1 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
LMO7Q8WWI1 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC29.58■■■□□ 2.33
LMO7Q8WWI1 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
LMO7Q8WWI1 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC29.58■■■□□ 2.33
LMO7Q8WWI1 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
LMO7Q8WWI1 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
LMO7Q8WWI1 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
LMO7Q8WWI1 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
LMO7Q8WWI1 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
LMO7Q8WWI1 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
LMO7Q8WWI1 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
LMO7Q8WWI1 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
LMO7Q8WWI1 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
LMO7Q8WWI1 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
LMO7Q8WWI1 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
LMO7Q8WWI1 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
LMO7Q8WWI1 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
LMO7Q8WWI1 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
LMO7Q8WWI1 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
LMO7Q8WWI1 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
LMO7Q8WWI1 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
LMO7Q8WWI1 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
LMO7Q8WWI1 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
LMO7Q8WWI1 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
LMO7Q8WWI1 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
LMO7Q8WWI1 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
LMO7Q8WWI1 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
LMO7Q8WWI1 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
LMO7Q8WWI1 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
LMO7Q8WWI1 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
LMO7Q8WWI1 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
LMO7Q8WWI1 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
LMO7Q8WWI1 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
LMO7Q8WWI1 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
LMO7Q8WWI1 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
LMO7Q8WWI1 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
LMO7Q8WWI1 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
LMO7Q8WWI1 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
LMO7Q8WWI1 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC29.54■■■□□ 2.32
LMO7Q8WWI1 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
LMO7Q8WWI1 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
LMO7Q8WWI1 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
LMO7Q8WWI1 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
LMO7Q8WWI1 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC29.53■■■□□ 2.32
LMO7Q8WWI1 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC29.53■■■□□ 2.32
LMO7Q8WWI1 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
LMO7Q8WWI1 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
LMO7Q8WWI1 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
LMO7Q8WWI1 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
LMO7Q8WWI1 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
LMO7Q8WWI1 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
LMO7Q8WWI1 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
LMO7Q8WWI1 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
LMO7Q8WWI1 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
LMO7Q8WWI1 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
LMO7Q8WWI1 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
LMO7Q8WWI1 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
LMO7Q8WWI1 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
LMO7Q8WWI1 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
LMO7Q8WWI1 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.2 ms