Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVM8

SCFD1, Sec1 family domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCFD1Q8WVM8 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCFD1Q8WVM8 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SCFD1Q8WVM8 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCFD1Q8WVM8 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCFD1Q8WVM8 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCFD1Q8WVM8 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCFD1Q8WVM8 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCFD1Q8WVM8 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCFD1Q8WVM8 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCFD1Q8WVM8 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCFD1Q8WVM8 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCFD1Q8WVM8 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCFD1Q8WVM8 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCFD1Q8WVM8 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCFD1Q8WVM8 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SCFD1Q8WVM8 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCFD1Q8WVM8 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCFD1Q8WVM8 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SCFD1Q8WVM8 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCFD1Q8WVM8 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCFD1Q8WVM8 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SCFD1Q8WVM8 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCFD1Q8WVM8 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCFD1Q8WVM8 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCFD1Q8WVM8 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SCFD1Q8WVM8 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SCFD1Q8WVM8 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SCFD1Q8WVM8 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SCFD1Q8WVM8 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCFD1Q8WVM8 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCFD1Q8WVM8 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCFD1Q8WVM8 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SCFD1Q8WVM8 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCFD1Q8WVM8 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCFD1Q8WVM8 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCFD1Q8WVM8 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCFD1Q8WVM8 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCFD1Q8WVM8 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCFD1Q8WVM8 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCFD1Q8WVM8 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCFD1Q8WVM8 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCFD1Q8WVM8 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCFD1Q8WVM8 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCFD1Q8WVM8 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCFD1Q8WVM8 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCFD1Q8WVM8 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCFD1Q8WVM8 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCFD1Q8WVM8 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SCFD1Q8WVM8 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCFD1Q8WVM8 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCFD1Q8WVM8 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCFD1Q8WVM8 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCFD1Q8WVM8 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCFD1Q8WVM8 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCFD1Q8WVM8 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCFD1Q8WVM8 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCFD1Q8WVM8 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCFD1Q8WVM8 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCFD1Q8WVM8 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCFD1Q8WVM8 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCFD1Q8WVM8 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCFD1Q8WVM8 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCFD1Q8WVM8 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCFD1Q8WVM8 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCFD1Q8WVM8 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCFD1Q8WVM8 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCFD1Q8WVM8 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SCFD1Q8WVM8 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCFD1Q8WVM8 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCFD1Q8WVM8 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCFD1Q8WVM8 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCFD1Q8WVM8 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCFD1Q8WVM8 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCFD1Q8WVM8 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCFD1Q8WVM8 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCFD1Q8WVM8 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCFD1Q8WVM8 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCFD1Q8WVM8 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SCFD1Q8WVM8 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCFD1Q8WVM8 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCFD1Q8WVM8 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCFD1Q8WVM8 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCFD1Q8WVM8 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCFD1Q8WVM8 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCFD1Q8WVM8 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCFD1Q8WVM8 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCFD1Q8WVM8 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCFD1Q8WVM8 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCFD1Q8WVM8 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCFD1Q8WVM8 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCFD1Q8WVM8 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SCFD1Q8WVM8 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCFD1Q8WVM8 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SCFD1Q8WVM8 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCFD1Q8WVM8 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCFD1Q8WVM8 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCFD1Q8WVM8 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SCFD1Q8WVM8 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SCFD1Q8WVM8 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCFD1Q8WVM8 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms