Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV44

TRIM41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM41Q8WV44 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
TRIM41Q8WV44 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC37.81■■■■□ 3.64
TRIM41Q8WV44 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC37.81■■■■□ 3.64
TRIM41Q8WV44 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
TRIM41Q8WV44 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC37.81■■■■□ 3.64
TRIM41Q8WV44 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC37.81■■■■□ 3.64
TRIM41Q8WV44 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC37.81■■■■□ 3.64
TRIM41Q8WV44 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
TRIM41Q8WV44 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
TRIM41Q8WV44 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
TRIM41Q8WV44 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
TRIM41Q8WV44 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC37.8■■■■□ 3.64
TRIM41Q8WV44 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
TRIM41Q8WV44 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
TRIM41Q8WV44 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC37.8■■■■□ 3.64
TRIM41Q8WV44 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
TRIM41Q8WV44 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC37.79■■■■□ 3.64
TRIM41Q8WV44 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC37.79■■■■□ 3.64
TRIM41Q8WV44 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
TRIM41Q8WV44 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
TRIM41Q8WV44 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC37.79■■■■□ 3.64
TRIM41Q8WV44 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC37.78■■■■□ 3.64
TRIM41Q8WV44 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC37.78■■■■□ 3.64
TRIM41Q8WV44 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC37.78■■■■□ 3.64
TRIM41Q8WV44 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
TRIM41Q8WV44 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
TRIM41Q8WV44 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.78■■■■□ 3.64
TRIM41Q8WV44 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
TRIM41Q8WV44 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.78■■■■□ 3.64
TRIM41Q8WV44 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC37.77■■■■□ 3.64
TRIM41Q8WV44 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
TRIM41Q8WV44 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC37.77■■■■□ 3.64
TRIM41Q8WV44 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
TRIM41Q8WV44 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.77■■■■□ 3.64
TRIM41Q8WV44 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC37.77■■■■□ 3.64
TRIM41Q8WV44 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
TRIM41Q8WV44 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.76■■■■□ 3.64
TRIM41Q8WV44 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
TRIM41Q8WV44 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC37.76■■■■□ 3.64
TRIM41Q8WV44 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC37.76■■■■□ 3.64
TRIM41Q8WV44 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.76■■■■□ 3.63
TRIM41Q8WV44 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC37.75■■■■□ 3.63
TRIM41Q8WV44 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
TRIM41Q8WV44 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC37.75■■■■□ 3.63
TRIM41Q8WV44 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC37.75■■■■□ 3.63
TRIM41Q8WV44 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC37.75■■■■□ 3.63
TRIM41Q8WV44 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
TRIM41Q8WV44 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
TRIM41Q8WV44 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC37.75■■■■□ 3.63
TRIM41Q8WV44 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC37.75■■■■□ 3.63
TRIM41Q8WV44 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
TRIM41Q8WV44 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
TRIM41Q8WV44 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
TRIM41Q8WV44 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
TRIM41Q8WV44 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
TRIM41Q8WV44 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC37.74■■■■□ 3.63
TRIM41Q8WV44 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
TRIM41Q8WV44 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.74■■■■□ 3.63
TRIM41Q8WV44 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
TRIM41Q8WV44 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC37.73■■■■□ 3.63
TRIM41Q8WV44 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC37.73■■■■□ 3.63
TRIM41Q8WV44 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC37.73■■■■□ 3.63
TRIM41Q8WV44 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
TRIM41Q8WV44 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC37.73■■■■□ 3.63
TRIM41Q8WV44 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC37.73■■■■□ 3.63
TRIM41Q8WV44 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
TRIM41Q8WV44 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC37.72■■■■□ 3.63
TRIM41Q8WV44 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC37.72■■■■□ 3.63
TRIM41Q8WV44 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
TRIM41Q8WV44 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
TRIM41Q8WV44 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC37.72■■■■□ 3.63
TRIM41Q8WV44 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC37.72■■■■□ 3.63
TRIM41Q8WV44 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
TRIM41Q8WV44 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
TRIM41Q8WV44 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC37.71■■■■□ 3.63
TRIM41Q8WV44 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC37.71■■■■□ 3.63
TRIM41Q8WV44 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC37.71■■■■□ 3.63
TRIM41Q8WV44 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC37.71■■■■□ 3.63
TRIM41Q8WV44 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
TRIM41Q8WV44 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC37.71■■■■□ 3.63
TRIM41Q8WV44 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.7■■■■□ 3.63
TRIM41Q8WV44 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC37.7■■■■□ 3.63
TRIM41Q8WV44 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
TRIM41Q8WV44 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC37.7■■■■□ 3.63
TRIM41Q8WV44 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC37.7■■■■□ 3.63
TRIM41Q8WV44 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC37.7■■■■□ 3.63
TRIM41Q8WV44 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
TRIM41Q8WV44 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
TRIM41Q8WV44 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
TRIM41Q8WV44 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC37.69■■■■□ 3.62
TRIM41Q8WV44 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC37.69■■■■□ 3.62
TRIM41Q8WV44 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC37.69■■■■□ 3.62
TRIM41Q8WV44 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC37.69■■■■□ 3.62
TRIM41Q8WV44 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC37.69■■■■□ 3.62
TRIM41Q8WV44 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC37.69■■■■□ 3.62
TRIM41Q8WV44 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
TRIM41Q8WV44 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
TRIM41Q8WV44 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
TRIM41Q8WV44 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.68■■■■□ 3.62
TRIM41Q8WV44 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 126.9 ms