Protein–RNA interactions for Protein: Q8TF30

WHAMM, WASP homolog-associated protein with actin, membranes and microtubules, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WHAMMQ8TF30 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
WHAMMQ8TF30 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
WHAMMQ8TF30 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
WHAMMQ8TF30 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
WHAMMQ8TF30 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
WHAMMQ8TF30 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
WHAMMQ8TF30 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
WHAMMQ8TF30 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
WHAMMQ8TF30 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
WHAMMQ8TF30 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
WHAMMQ8TF30 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
WHAMMQ8TF30 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
WHAMMQ8TF30 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
WHAMMQ8TF30 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
WHAMMQ8TF30 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
WHAMMQ8TF30 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
WHAMMQ8TF30 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
WHAMMQ8TF30 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
WHAMMQ8TF30 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
WHAMMQ8TF30 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
WHAMMQ8TF30 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
WHAMMQ8TF30 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
WHAMMQ8TF30 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
WHAMMQ8TF30 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
WHAMMQ8TF30 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
WHAMMQ8TF30 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
WHAMMQ8TF30 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
WHAMMQ8TF30 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
WHAMMQ8TF30 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
WHAMMQ8TF30 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
WHAMMQ8TF30 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
WHAMMQ8TF30 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
WHAMMQ8TF30 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
WHAMMQ8TF30 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
WHAMMQ8TF30 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
WHAMMQ8TF30 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
WHAMMQ8TF30 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
WHAMMQ8TF30 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
WHAMMQ8TF30 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
WHAMMQ8TF30 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
WHAMMQ8TF30 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
WHAMMQ8TF30 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
WHAMMQ8TF30 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
WHAMMQ8TF30 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
WHAMMQ8TF30 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
WHAMMQ8TF30 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
WHAMMQ8TF30 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
WHAMMQ8TF30 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
WHAMMQ8TF30 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
WHAMMQ8TF30 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
WHAMMQ8TF30 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
WHAMMQ8TF30 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
WHAMMQ8TF30 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
WHAMMQ8TF30 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
WHAMMQ8TF30 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
WHAMMQ8TF30 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
WHAMMQ8TF30 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
WHAMMQ8TF30 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
WHAMMQ8TF30 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
WHAMMQ8TF30 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
WHAMMQ8TF30 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
WHAMMQ8TF30 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
WHAMMQ8TF30 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
WHAMMQ8TF30 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
WHAMMQ8TF30 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
WHAMMQ8TF30 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
WHAMMQ8TF30 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
WHAMMQ8TF30 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
WHAMMQ8TF30 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
WHAMMQ8TF30 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
WHAMMQ8TF30 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
WHAMMQ8TF30 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
WHAMMQ8TF30 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
WHAMMQ8TF30 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
WHAMMQ8TF30 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
WHAMMQ8TF30 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
WHAMMQ8TF30 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
WHAMMQ8TF30 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
WHAMMQ8TF30 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
WHAMMQ8TF30 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
WHAMMQ8TF30 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
WHAMMQ8TF30 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
WHAMMQ8TF30 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
WHAMMQ8TF30 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
WHAMMQ8TF30 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
WHAMMQ8TF30 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
WHAMMQ8TF30 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
WHAMMQ8TF30 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
WHAMMQ8TF30 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
WHAMMQ8TF30 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
WHAMMQ8TF30 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
WHAMMQ8TF30 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
WHAMMQ8TF30 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
WHAMMQ8TF30 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
WHAMMQ8TF30 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
WHAMMQ8TF30 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
WHAMMQ8TF30 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
WHAMMQ8TF30 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
WHAMMQ8TF30 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
WHAMMQ8TF30 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms