Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEB9

RHBDD1, Rhomboid-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDD1Q8TEB9 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RHBDD1Q8TEB9 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RHBDD1Q8TEB9 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RHBDD1Q8TEB9 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RHBDD1Q8TEB9 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
RHBDD1Q8TEB9 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
RHBDD1Q8TEB9 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RHBDD1Q8TEB9 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RHBDD1Q8TEB9 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RHBDD1Q8TEB9 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RHBDD1Q8TEB9 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RHBDD1Q8TEB9 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RHBDD1Q8TEB9 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RHBDD1Q8TEB9 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RHBDD1Q8TEB9 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RHBDD1Q8TEB9 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RHBDD1Q8TEB9 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RHBDD1Q8TEB9 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RHBDD1Q8TEB9 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RHBDD1Q8TEB9 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RHBDD1Q8TEB9 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RHBDD1Q8TEB9 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RHBDD1Q8TEB9 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RHBDD1Q8TEB9 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RHBDD1Q8TEB9 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RHBDD1Q8TEB9 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
RHBDD1Q8TEB9 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RHBDD1Q8TEB9 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RHBDD1Q8TEB9 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RHBDD1Q8TEB9 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RHBDD1Q8TEB9 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RHBDD1Q8TEB9 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RHBDD1Q8TEB9 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RHBDD1Q8TEB9 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RHBDD1Q8TEB9 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RHBDD1Q8TEB9 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RHBDD1Q8TEB9 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RHBDD1Q8TEB9 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
RHBDD1Q8TEB9 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
RHBDD1Q8TEB9 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RHBDD1Q8TEB9 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RHBDD1Q8TEB9 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RHBDD1Q8TEB9 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
RHBDD1Q8TEB9 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RHBDD1Q8TEB9 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RHBDD1Q8TEB9 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RHBDD1Q8TEB9 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RHBDD1Q8TEB9 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RHBDD1Q8TEB9 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RHBDD1Q8TEB9 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RHBDD1Q8TEB9 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RHBDD1Q8TEB9 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RHBDD1Q8TEB9 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RHBDD1Q8TEB9 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RHBDD1Q8TEB9 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RHBDD1Q8TEB9 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RHBDD1Q8TEB9 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RHBDD1Q8TEB9 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RHBDD1Q8TEB9 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RHBDD1Q8TEB9 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RHBDD1Q8TEB9 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RHBDD1Q8TEB9 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RHBDD1Q8TEB9 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
RHBDD1Q8TEB9 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RHBDD1Q8TEB9 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RHBDD1Q8TEB9 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RHBDD1Q8TEB9 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RHBDD1Q8TEB9 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RHBDD1Q8TEB9 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RHBDD1Q8TEB9 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RHBDD1Q8TEB9 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RHBDD1Q8TEB9 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RHBDD1Q8TEB9 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RHBDD1Q8TEB9 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
RHBDD1Q8TEB9 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
RHBDD1Q8TEB9 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RHBDD1Q8TEB9 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RHBDD1Q8TEB9 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RHBDD1Q8TEB9 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RHBDD1Q8TEB9 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RHBDD1Q8TEB9 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RHBDD1Q8TEB9 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RHBDD1Q8TEB9 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RHBDD1Q8TEB9 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RHBDD1Q8TEB9 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RHBDD1Q8TEB9 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RHBDD1Q8TEB9 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RHBDD1Q8TEB9 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RHBDD1Q8TEB9 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RHBDD1Q8TEB9 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RHBDD1Q8TEB9 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RHBDD1Q8TEB9 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RHBDD1Q8TEB9 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RHBDD1Q8TEB9 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RHBDD1Q8TEB9 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RHBDD1Q8TEB9 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RHBDD1Q8TEB9 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RHBDD1Q8TEB9 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RHBDD1Q8TEB9 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RHBDD1Q8TEB9 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms