Protein–RNA interactions for Protein: Q8TD17

ZNF398, Zinc finger protein 398, humanhuman

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Length 642 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF398Q8TD17 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF398Q8TD17 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF398Q8TD17 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF398Q8TD17 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF398Q8TD17 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF398Q8TD17 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF398Q8TD17 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF398Q8TD17 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF398Q8TD17 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF398Q8TD17 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF398Q8TD17 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF398Q8TD17 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF398Q8TD17 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF398Q8TD17 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF398Q8TD17 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF398Q8TD17 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF398Q8TD17 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF398Q8TD17 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF398Q8TD17 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF398Q8TD17 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF398Q8TD17 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF398Q8TD17 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF398Q8TD17 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF398Q8TD17 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF398Q8TD17 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF398Q8TD17 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF398Q8TD17 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF398Q8TD17 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF398Q8TD17 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF398Q8TD17 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF398Q8TD17 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF398Q8TD17 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF398Q8TD17 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF398Q8TD17 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF398Q8TD17 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF398Q8TD17 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF398Q8TD17 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF398Q8TD17 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF398Q8TD17 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF398Q8TD17 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF398Q8TD17 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF398Q8TD17 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF398Q8TD17 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF398Q8TD17 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF398Q8TD17 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF398Q8TD17 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF398Q8TD17 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF398Q8TD17 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF398Q8TD17 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF398Q8TD17 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF398Q8TD17 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF398Q8TD17 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF398Q8TD17 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF398Q8TD17 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF398Q8TD17 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF398Q8TD17 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF398Q8TD17 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF398Q8TD17 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF398Q8TD17 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF398Q8TD17 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF398Q8TD17 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF398Q8TD17 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF398Q8TD17 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF398Q8TD17 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF398Q8TD17 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF398Q8TD17 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF398Q8TD17 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF398Q8TD17 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF398Q8TD17 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF398Q8TD17 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF398Q8TD17 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF398Q8TD17 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF398Q8TD17 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF398Q8TD17 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF398Q8TD17 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF398Q8TD17 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF398Q8TD17 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF398Q8TD17 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF398Q8TD17 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF398Q8TD17 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF398Q8TD17 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF398Q8TD17 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF398Q8TD17 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF398Q8TD17 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF398Q8TD17 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF398Q8TD17 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF398Q8TD17 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF398Q8TD17 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF398Q8TD17 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF398Q8TD17 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF398Q8TD17 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF398Q8TD17 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF398Q8TD17 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF398Q8TD17 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF398Q8TD17 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF398Q8TD17 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF398Q8TD17 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF398Q8TD17 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF398Q8TD17 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF398Q8TD17 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
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