Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAX9

GSDMB, Gasdermin-B, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMBQ8TAX9 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GSDMBQ8TAX9 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GSDMBQ8TAX9 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
GSDMBQ8TAX9 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GSDMBQ8TAX9 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GSDMBQ8TAX9 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GSDMBQ8TAX9 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GSDMBQ8TAX9 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GSDMBQ8TAX9 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GSDMBQ8TAX9 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GSDMBQ8TAX9 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GSDMBQ8TAX9 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GSDMBQ8TAX9 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GSDMBQ8TAX9 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
GSDMBQ8TAX9 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GSDMBQ8TAX9 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GSDMBQ8TAX9 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GSDMBQ8TAX9 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GSDMBQ8TAX9 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GSDMBQ8TAX9 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GSDMBQ8TAX9 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
GSDMBQ8TAX9 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GSDMBQ8TAX9 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GSDMBQ8TAX9 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GSDMBQ8TAX9 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GSDMBQ8TAX9 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GSDMBQ8TAX9 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GSDMBQ8TAX9 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
GSDMBQ8TAX9 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GSDMBQ8TAX9 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GSDMBQ8TAX9 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GSDMBQ8TAX9 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GSDMBQ8TAX9 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GSDMBQ8TAX9 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GSDMBQ8TAX9 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GSDMBQ8TAX9 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
GSDMBQ8TAX9 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GSDMBQ8TAX9 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GSDMBQ8TAX9 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GSDMBQ8TAX9 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GSDMBQ8TAX9 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GSDMBQ8TAX9 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GSDMBQ8TAX9 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GSDMBQ8TAX9 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GSDMBQ8TAX9 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GSDMBQ8TAX9 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GSDMBQ8TAX9 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GSDMBQ8TAX9 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GSDMBQ8TAX9 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
GSDMBQ8TAX9 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GSDMBQ8TAX9 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GSDMBQ8TAX9 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GSDMBQ8TAX9 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GSDMBQ8TAX9 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GSDMBQ8TAX9 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GSDMBQ8TAX9 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GSDMBQ8TAX9 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GSDMBQ8TAX9 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GSDMBQ8TAX9 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GSDMBQ8TAX9 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GSDMBQ8TAX9 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GSDMBQ8TAX9 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
GSDMBQ8TAX9 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GSDMBQ8TAX9 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GSDMBQ8TAX9 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GSDMBQ8TAX9 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GSDMBQ8TAX9 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GSDMBQ8TAX9 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GSDMBQ8TAX9 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
GSDMBQ8TAX9 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GSDMBQ8TAX9 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GSDMBQ8TAX9 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GSDMBQ8TAX9 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GSDMBQ8TAX9 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GSDMBQ8TAX9 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GSDMBQ8TAX9 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GSDMBQ8TAX9 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GSDMBQ8TAX9 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GSDMBQ8TAX9 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
GSDMBQ8TAX9 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GSDMBQ8TAX9 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GSDMBQ8TAX9 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GSDMBQ8TAX9 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GSDMBQ8TAX9 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GSDMBQ8TAX9 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GSDMBQ8TAX9 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GSDMBQ8TAX9 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GSDMBQ8TAX9 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GSDMBQ8TAX9 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GSDMBQ8TAX9 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GSDMBQ8TAX9 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GSDMBQ8TAX9 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GSDMBQ8TAX9 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GSDMBQ8TAX9 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GSDMBQ8TAX9 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GSDMBQ8TAX9 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GSDMBQ8TAX9 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GSDMBQ8TAX9 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GSDMBQ8TAX9 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GSDMBQ8TAX9 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms