Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAP4

LMO3, LIM domain only protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3Q8TAP4 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
LMO3Q8TAP4 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LMO3Q8TAP4 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LMO3Q8TAP4 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LMO3Q8TAP4 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LMO3Q8TAP4 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LMO3Q8TAP4 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LMO3Q8TAP4 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LMO3Q8TAP4 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LMO3Q8TAP4 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LMO3Q8TAP4 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LMO3Q8TAP4 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LMO3Q8TAP4 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LMO3Q8TAP4 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LMO3Q8TAP4 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LMO3Q8TAP4 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LMO3Q8TAP4 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LMO3Q8TAP4 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LMO3Q8TAP4 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LMO3Q8TAP4 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LMO3Q8TAP4 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LMO3Q8TAP4 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LMO3Q8TAP4 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LMO3Q8TAP4 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LMO3Q8TAP4 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LMO3Q8TAP4 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LMO3Q8TAP4 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LMO3Q8TAP4 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LMO3Q8TAP4 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
LMO3Q8TAP4 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LMO3Q8TAP4 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LMO3Q8TAP4 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LMO3Q8TAP4 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LMO3Q8TAP4 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LMO3Q8TAP4 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LMO3Q8TAP4 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LMO3Q8TAP4 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LMO3Q8TAP4 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LMO3Q8TAP4 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LMO3Q8TAP4 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LMO3Q8TAP4 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
LMO3Q8TAP4 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LMO3Q8TAP4 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
LMO3Q8TAP4 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
LMO3Q8TAP4 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LMO3Q8TAP4 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LMO3Q8TAP4 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LMO3Q8TAP4 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LMO3Q8TAP4 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LMO3Q8TAP4 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LMO3Q8TAP4 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LMO3Q8TAP4 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LMO3Q8TAP4 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LMO3Q8TAP4 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LMO3Q8TAP4 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LMO3Q8TAP4 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
LMO3Q8TAP4 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LMO3Q8TAP4 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LMO3Q8TAP4 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LMO3Q8TAP4 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LMO3Q8TAP4 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LMO3Q8TAP4 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LMO3Q8TAP4 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LMO3Q8TAP4 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LMO3Q8TAP4 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LMO3Q8TAP4 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LMO3Q8TAP4 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
LMO3Q8TAP4 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LMO3Q8TAP4 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
LMO3Q8TAP4 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LMO3Q8TAP4 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LMO3Q8TAP4 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LMO3Q8TAP4 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LMO3Q8TAP4 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LMO3Q8TAP4 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LMO3Q8TAP4 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LMO3Q8TAP4 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LMO3Q8TAP4 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LMO3Q8TAP4 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
LMO3Q8TAP4 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
LMO3Q8TAP4 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LMO3Q8TAP4 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LMO3Q8TAP4 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LMO3Q8TAP4 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LMO3Q8TAP4 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LMO3Q8TAP4 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LMO3Q8TAP4 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LMO3Q8TAP4 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LMO3Q8TAP4 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LMO3Q8TAP4 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LMO3Q8TAP4 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LMO3Q8TAP4 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LMO3Q8TAP4 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LMO3Q8TAP4 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LMO3Q8TAP4 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LMO3Q8TAP4 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
LMO3Q8TAP4 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LMO3Q8TAP4 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LMO3Q8TAP4 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LMO3Q8TAP4 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms