Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEV1

CSNK2A3, Casein kinase II subunit alpha 3, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A3Q8NEV1 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CSNK2A3Q8NEV1 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CSNK2A3Q8NEV1 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CSNK2A3Q8NEV1 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CSNK2A3Q8NEV1 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CSNK2A3Q8NEV1 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CSNK2A3Q8NEV1 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CSNK2A3Q8NEV1 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CSNK2A3Q8NEV1 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CSNK2A3Q8NEV1 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CSNK2A3Q8NEV1 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CSNK2A3Q8NEV1 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CSNK2A3Q8NEV1 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CSNK2A3Q8NEV1 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CSNK2A3Q8NEV1 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CSNK2A3Q8NEV1 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CSNK2A3Q8NEV1 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CSNK2A3Q8NEV1 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CSNK2A3Q8NEV1 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CSNK2A3Q8NEV1 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CSNK2A3Q8NEV1 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CSNK2A3Q8NEV1 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CSNK2A3Q8NEV1 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CSNK2A3Q8NEV1 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CSNK2A3Q8NEV1 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CSNK2A3Q8NEV1 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CSNK2A3Q8NEV1 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CSNK2A3Q8NEV1 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CSNK2A3Q8NEV1 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CSNK2A3Q8NEV1 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CSNK2A3Q8NEV1 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CSNK2A3Q8NEV1 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CSNK2A3Q8NEV1 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CSNK2A3Q8NEV1 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CSNK2A3Q8NEV1 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CSNK2A3Q8NEV1 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CSNK2A3Q8NEV1 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CSNK2A3Q8NEV1 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CSNK2A3Q8NEV1 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CSNK2A3Q8NEV1 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CSNK2A3Q8NEV1 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CSNK2A3Q8NEV1 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CSNK2A3Q8NEV1 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CSNK2A3Q8NEV1 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CSNK2A3Q8NEV1 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CSNK2A3Q8NEV1 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CSNK2A3Q8NEV1 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CSNK2A3Q8NEV1 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CSNK2A3Q8NEV1 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CSNK2A3Q8NEV1 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CSNK2A3Q8NEV1 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CSNK2A3Q8NEV1 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CSNK2A3Q8NEV1 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CSNK2A3Q8NEV1 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CSNK2A3Q8NEV1 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CSNK2A3Q8NEV1 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CSNK2A3Q8NEV1 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CSNK2A3Q8NEV1 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CSNK2A3Q8NEV1 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CSNK2A3Q8NEV1 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CSNK2A3Q8NEV1 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CSNK2A3Q8NEV1 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CSNK2A3Q8NEV1 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CSNK2A3Q8NEV1 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CSNK2A3Q8NEV1 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CSNK2A3Q8NEV1 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CSNK2A3Q8NEV1 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CSNK2A3Q8NEV1 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CSNK2A3Q8NEV1 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CSNK2A3Q8NEV1 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CSNK2A3Q8NEV1 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CSNK2A3Q8NEV1 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CSNK2A3Q8NEV1 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CSNK2A3Q8NEV1 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CSNK2A3Q8NEV1 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CSNK2A3Q8NEV1 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CSNK2A3Q8NEV1 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CSNK2A3Q8NEV1 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CSNK2A3Q8NEV1 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CSNK2A3Q8NEV1 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CSNK2A3Q8NEV1 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CSNK2A3Q8NEV1 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CSNK2A3Q8NEV1 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CSNK2A3Q8NEV1 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CSNK2A3Q8NEV1 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CSNK2A3Q8NEV1 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CSNK2A3Q8NEV1 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CSNK2A3Q8NEV1 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CSNK2A3Q8NEV1 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CSNK2A3Q8NEV1 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CSNK2A3Q8NEV1 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CSNK2A3Q8NEV1 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CSNK2A3Q8NEV1 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CSNK2A3Q8NEV1 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CSNK2A3Q8NEV1 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CSNK2A3Q8NEV1 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CSNK2A3Q8NEV1 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CSNK2A3Q8NEV1 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CSNK2A3Q8NEV1 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms