Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCN5

PDPR, Pyruvate dehydrogenase phosphatase regulatory subunit, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 879 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDPRQ8NCN5 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDPRQ8NCN5 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDPRQ8NCN5 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDPRQ8NCN5 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDPRQ8NCN5 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDPRQ8NCN5 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDPRQ8NCN5 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDPRQ8NCN5 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDPRQ8NCN5 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PDPRQ8NCN5 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PDPRQ8NCN5 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDPRQ8NCN5 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDPRQ8NCN5 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDPRQ8NCN5 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDPRQ8NCN5 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDPRQ8NCN5 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDPRQ8NCN5 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDPRQ8NCN5 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDPRQ8NCN5 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDPRQ8NCN5 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDPRQ8NCN5 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDPRQ8NCN5 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDPRQ8NCN5 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDPRQ8NCN5 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PDPRQ8NCN5 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDPRQ8NCN5 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDPRQ8NCN5 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDPRQ8NCN5 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDPRQ8NCN5 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDPRQ8NCN5 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDPRQ8NCN5 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDPRQ8NCN5 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDPRQ8NCN5 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDPRQ8NCN5 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDPRQ8NCN5 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDPRQ8NCN5 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDPRQ8NCN5 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDPRQ8NCN5 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDPRQ8NCN5 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDPRQ8NCN5 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDPRQ8NCN5 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDPRQ8NCN5 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDPRQ8NCN5 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDPRQ8NCN5 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PDPRQ8NCN5 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDPRQ8NCN5 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDPRQ8NCN5 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDPRQ8NCN5 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDPRQ8NCN5 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDPRQ8NCN5 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDPRQ8NCN5 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDPRQ8NCN5 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDPRQ8NCN5 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDPRQ8NCN5 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDPRQ8NCN5 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDPRQ8NCN5 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDPRQ8NCN5 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDPRQ8NCN5 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDPRQ8NCN5 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDPRQ8NCN5 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDPRQ8NCN5 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDPRQ8NCN5 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDPRQ8NCN5 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDPRQ8NCN5 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDPRQ8NCN5 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDPRQ8NCN5 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDPRQ8NCN5 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDPRQ8NCN5 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDPRQ8NCN5 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDPRQ8NCN5 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PDPRQ8NCN5 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDPRQ8NCN5 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDPRQ8NCN5 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDPRQ8NCN5 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDPRQ8NCN5 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDPRQ8NCN5 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDPRQ8NCN5 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDPRQ8NCN5 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDPRQ8NCN5 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDPRQ8NCN5 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDPRQ8NCN5 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDPRQ8NCN5 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDPRQ8NCN5 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDPRQ8NCN5 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDPRQ8NCN5 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDPRQ8NCN5 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDPRQ8NCN5 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDPRQ8NCN5 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDPRQ8NCN5 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDPRQ8NCN5 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDPRQ8NCN5 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PDPRQ8NCN5 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDPRQ8NCN5 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDPRQ8NCN5 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDPRQ8NCN5 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDPRQ8NCN5 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDPRQ8NCN5 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDPRQ8NCN5 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDPRQ8NCN5 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDPRQ8NCN5 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms