Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCD3

HJURP, Holliday junction recognition protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HJURPQ8NCD3 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HJURPQ8NCD3 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HJURPQ8NCD3 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HJURPQ8NCD3 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HJURPQ8NCD3 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HJURPQ8NCD3 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HJURPQ8NCD3 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HJURPQ8NCD3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HJURPQ8NCD3 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HJURPQ8NCD3 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HJURPQ8NCD3 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HJURPQ8NCD3 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HJURPQ8NCD3 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HJURPQ8NCD3 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HJURPQ8NCD3 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HJURPQ8NCD3 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HJURPQ8NCD3 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HJURPQ8NCD3 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HJURPQ8NCD3 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HJURPQ8NCD3 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HJURPQ8NCD3 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HJURPQ8NCD3 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HJURPQ8NCD3 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
HJURPQ8NCD3 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HJURPQ8NCD3 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
HJURPQ8NCD3 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HJURPQ8NCD3 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HJURPQ8NCD3 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HJURPQ8NCD3 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HJURPQ8NCD3 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HJURPQ8NCD3 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HJURPQ8NCD3 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HJURPQ8NCD3 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HJURPQ8NCD3 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HJURPQ8NCD3 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HJURPQ8NCD3 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HJURPQ8NCD3 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HJURPQ8NCD3 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HJURPQ8NCD3 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HJURPQ8NCD3 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HJURPQ8NCD3 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HJURPQ8NCD3 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
HJURPQ8NCD3 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HJURPQ8NCD3 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HJURPQ8NCD3 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HJURPQ8NCD3 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HJURPQ8NCD3 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HJURPQ8NCD3 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HJURPQ8NCD3 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HJURPQ8NCD3 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
HJURPQ8NCD3 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HJURPQ8NCD3 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HJURPQ8NCD3 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HJURPQ8NCD3 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HJURPQ8NCD3 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HJURPQ8NCD3 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
HJURPQ8NCD3 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HJURPQ8NCD3 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HJURPQ8NCD3 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HJURPQ8NCD3 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HJURPQ8NCD3 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HJURPQ8NCD3 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HJURPQ8NCD3 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HJURPQ8NCD3 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HJURPQ8NCD3 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HJURPQ8NCD3 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HJURPQ8NCD3 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HJURPQ8NCD3 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HJURPQ8NCD3 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
HJURPQ8NCD3 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HJURPQ8NCD3 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HJURPQ8NCD3 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HJURPQ8NCD3 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HJURPQ8NCD3 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
HJURPQ8NCD3 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HJURPQ8NCD3 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HJURPQ8NCD3 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HJURPQ8NCD3 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HJURPQ8NCD3 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HJURPQ8NCD3 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HJURPQ8NCD3 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HJURPQ8NCD3 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HJURPQ8NCD3 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HJURPQ8NCD3 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HJURPQ8NCD3 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HJURPQ8NCD3 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HJURPQ8NCD3 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
HJURPQ8NCD3 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HJURPQ8NCD3 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HJURPQ8NCD3 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HJURPQ8NCD3 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HJURPQ8NCD3 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HJURPQ8NCD3 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HJURPQ8NCD3 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HJURPQ8NCD3 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HJURPQ8NCD3 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HJURPQ8NCD3 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
HJURPQ8NCD3 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HJURPQ8NCD3 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
HJURPQ8NCD3 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.8 ms