Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6U2

LINC00612, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00612, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00612Q8N6U2 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00612Q8N6U2 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00612Q8N6U2 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00612Q8N6U2 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00612Q8N6U2 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00612Q8N6U2 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00612Q8N6U2 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00612Q8N6U2 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00612Q8N6U2 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00612Q8N6U2 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00612Q8N6U2 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00612Q8N6U2 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00612Q8N6U2 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00612Q8N6U2 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00612Q8N6U2 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00612Q8N6U2 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LINC00612Q8N6U2 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LINC00612Q8N6U2 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00612Q8N6U2 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00612Q8N6U2 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00612Q8N6U2 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00612Q8N6U2 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00612Q8N6U2 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00612Q8N6U2 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00612Q8N6U2 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00612Q8N6U2 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00612Q8N6U2 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00612Q8N6U2 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00612Q8N6U2 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00612Q8N6U2 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00612Q8N6U2 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00612Q8N6U2 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00612Q8N6U2 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00612Q8N6U2 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00612Q8N6U2 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00612Q8N6U2 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00612Q8N6U2 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00612Q8N6U2 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00612Q8N6U2 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00612Q8N6U2 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00612Q8N6U2 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00612Q8N6U2 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00612Q8N6U2 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00612Q8N6U2 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00612Q8N6U2 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00612Q8N6U2 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00612Q8N6U2 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00612Q8N6U2 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00612Q8N6U2 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00612Q8N6U2 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00612Q8N6U2 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00612Q8N6U2 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00612Q8N6U2 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00612Q8N6U2 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00612Q8N6U2 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00612Q8N6U2 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00612Q8N6U2 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00612Q8N6U2 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00612Q8N6U2 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00612Q8N6U2 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00612Q8N6U2 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00612Q8N6U2 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00612Q8N6U2 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00612Q8N6U2 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00612Q8N6U2 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00612Q8N6U2 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00612Q8N6U2 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00612Q8N6U2 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00612Q8N6U2 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00612Q8N6U2 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00612Q8N6U2 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00612Q8N6U2 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00612Q8N6U2 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00612Q8N6U2 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00612Q8N6U2 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00612Q8N6U2 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00612Q8N6U2 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00612Q8N6U2 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00612Q8N6U2 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00612Q8N6U2 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00612Q8N6U2 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00612Q8N6U2 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00612Q8N6U2 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00612Q8N6U2 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00612Q8N6U2 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00612Q8N6U2 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00612Q8N6U2 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00612Q8N6U2 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00612Q8N6U2 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00612Q8N6U2 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00612Q8N6U2 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00612Q8N6U2 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00612Q8N6U2 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00612Q8N6U2 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00612Q8N6U2 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00612Q8N6U2 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00612Q8N6U2 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00612Q8N6U2 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00612Q8N6U2 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00612Q8N6U2 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms