Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZ73

RPUSD2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD2Q8IZ73 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RPUSD2Q8IZ73 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RPUSD2Q8IZ73 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RPUSD2Q8IZ73 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RPUSD2Q8IZ73 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RPUSD2Q8IZ73 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RPUSD2Q8IZ73 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RPUSD2Q8IZ73 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RPUSD2Q8IZ73 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RPUSD2Q8IZ73 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RPUSD2Q8IZ73 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RPUSD2Q8IZ73 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPUSD2Q8IZ73 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPUSD2Q8IZ73 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPUSD2Q8IZ73 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPUSD2Q8IZ73 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPUSD2Q8IZ73 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPUSD2Q8IZ73 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPUSD2Q8IZ73 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPUSD2Q8IZ73 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPUSD2Q8IZ73 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPUSD2Q8IZ73 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RPUSD2Q8IZ73 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RPUSD2Q8IZ73 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RPUSD2Q8IZ73 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RPUSD2Q8IZ73 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RPUSD2Q8IZ73 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
RPUSD2Q8IZ73 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RPUSD2Q8IZ73 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
RPUSD2Q8IZ73 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RPUSD2Q8IZ73 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RPUSD2Q8IZ73 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RPUSD2Q8IZ73 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RPUSD2Q8IZ73 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RPUSD2Q8IZ73 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RPUSD2Q8IZ73 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RPUSD2Q8IZ73 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RPUSD2Q8IZ73 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RPUSD2Q8IZ73 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RPUSD2Q8IZ73 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RPUSD2Q8IZ73 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RPUSD2Q8IZ73 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RPUSD2Q8IZ73 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RPUSD2Q8IZ73 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RPUSD2Q8IZ73 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RPUSD2Q8IZ73 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RPUSD2Q8IZ73 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RPUSD2Q8IZ73 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RPUSD2Q8IZ73 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RPUSD2Q8IZ73 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RPUSD2Q8IZ73 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RPUSD2Q8IZ73 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RPUSD2Q8IZ73 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RPUSD2Q8IZ73 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
RPUSD2Q8IZ73 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RPUSD2Q8IZ73 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
RPUSD2Q8IZ73 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RPUSD2Q8IZ73 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RPUSD2Q8IZ73 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RPUSD2Q8IZ73 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RPUSD2Q8IZ73 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RPUSD2Q8IZ73 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RPUSD2Q8IZ73 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RPUSD2Q8IZ73 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RPUSD2Q8IZ73 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RPUSD2Q8IZ73 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
RPUSD2Q8IZ73 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RPUSD2Q8IZ73 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RPUSD2Q8IZ73 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RPUSD2Q8IZ73 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RPUSD2Q8IZ73 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RPUSD2Q8IZ73 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RPUSD2Q8IZ73 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RPUSD2Q8IZ73 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RPUSD2Q8IZ73 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RPUSD2Q8IZ73 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RPUSD2Q8IZ73 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RPUSD2Q8IZ73 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RPUSD2Q8IZ73 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RPUSD2Q8IZ73 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RPUSD2Q8IZ73 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RPUSD2Q8IZ73 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RPUSD2Q8IZ73 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RPUSD2Q8IZ73 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
RPUSD2Q8IZ73 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RPUSD2Q8IZ73 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RPUSD2Q8IZ73 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RPUSD2Q8IZ73 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RPUSD2Q8IZ73 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RPUSD2Q8IZ73 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RPUSD2Q8IZ73 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RPUSD2Q8IZ73 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RPUSD2Q8IZ73 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RPUSD2Q8IZ73 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RPUSD2Q8IZ73 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RPUSD2Q8IZ73 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RPUSD2Q8IZ73 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RPUSD2Q8IZ73 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RPUSD2Q8IZ73 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RPUSD2Q8IZ73 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms