Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVJ8

APRG1, AP20 region protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APRG1Q8IVJ8 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APRG1Q8IVJ8 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APRG1Q8IVJ8 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
APRG1Q8IVJ8 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
APRG1Q8IVJ8 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APRG1Q8IVJ8 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
APRG1Q8IVJ8 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
APRG1Q8IVJ8 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APRG1Q8IVJ8 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
APRG1Q8IVJ8 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APRG1Q8IVJ8 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
APRG1Q8IVJ8 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
APRG1Q8IVJ8 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
APRG1Q8IVJ8 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
APRG1Q8IVJ8 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APRG1Q8IVJ8 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
APRG1Q8IVJ8 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
APRG1Q8IVJ8 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
APRG1Q8IVJ8 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
APRG1Q8IVJ8 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APRG1Q8IVJ8 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APRG1Q8IVJ8 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APRG1Q8IVJ8 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
APRG1Q8IVJ8 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
APRG1Q8IVJ8 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APRG1Q8IVJ8 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APRG1Q8IVJ8 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
APRG1Q8IVJ8 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APRG1Q8IVJ8 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APRG1Q8IVJ8 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
APRG1Q8IVJ8 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
APRG1Q8IVJ8 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APRG1Q8IVJ8 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APRG1Q8IVJ8 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APRG1Q8IVJ8 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
APRG1Q8IVJ8 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
APRG1Q8IVJ8 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APRG1Q8IVJ8 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APRG1Q8IVJ8 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APRG1Q8IVJ8 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
APRG1Q8IVJ8 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
APRG1Q8IVJ8 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APRG1Q8IVJ8 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APRG1Q8IVJ8 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
APRG1Q8IVJ8 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
APRG1Q8IVJ8 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
APRG1Q8IVJ8 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
APRG1Q8IVJ8 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
APRG1Q8IVJ8 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
APRG1Q8IVJ8 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
APRG1Q8IVJ8 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
APRG1Q8IVJ8 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
APRG1Q8IVJ8 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
APRG1Q8IVJ8 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
APRG1Q8IVJ8 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
APRG1Q8IVJ8 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
APRG1Q8IVJ8 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
APRG1Q8IVJ8 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
APRG1Q8IVJ8 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
APRG1Q8IVJ8 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
APRG1Q8IVJ8 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
APRG1Q8IVJ8 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
APRG1Q8IVJ8 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
APRG1Q8IVJ8 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
APRG1Q8IVJ8 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
APRG1Q8IVJ8 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
APRG1Q8IVJ8 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
APRG1Q8IVJ8 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
APRG1Q8IVJ8 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
APRG1Q8IVJ8 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
APRG1Q8IVJ8 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
APRG1Q8IVJ8 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
APRG1Q8IVJ8 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
APRG1Q8IVJ8 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
APRG1Q8IVJ8 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
APRG1Q8IVJ8 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
APRG1Q8IVJ8 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
APRG1Q8IVJ8 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
APRG1Q8IVJ8 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
APRG1Q8IVJ8 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
APRG1Q8IVJ8 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
APRG1Q8IVJ8 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
APRG1Q8IVJ8 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
APRG1Q8IVJ8 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
APRG1Q8IVJ8 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
APRG1Q8IVJ8 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
APRG1Q8IVJ8 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
APRG1Q8IVJ8 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
APRG1Q8IVJ8 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
APRG1Q8IVJ8 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
APRG1Q8IVJ8 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
APRG1Q8IVJ8 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
APRG1Q8IVJ8 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
APRG1Q8IVJ8 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
APRG1Q8IVJ8 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
APRG1Q8IVJ8 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
APRG1Q8IVJ8 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
APRG1Q8IVJ8 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
APRG1Q8IVJ8 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
APRG1Q8IVJ8 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms