Protein–RNA interactions for Protein: Q8IU80

TMPRSS6, Transmembrane protease serine 6, humanhuman

Predictions only

Length 811 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS6Q8IU80 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMPRSS6Q8IU80 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMPRSS6Q8IU80 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMPRSS6Q8IU80 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMPRSS6Q8IU80 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMPRSS6Q8IU80 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMPRSS6Q8IU80 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMPRSS6Q8IU80 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMPRSS6Q8IU80 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMPRSS6Q8IU80 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMPRSS6Q8IU80 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMPRSS6Q8IU80 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMPRSS6Q8IU80 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMPRSS6Q8IU80 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMPRSS6Q8IU80 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMPRSS6Q8IU80 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMPRSS6Q8IU80 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMPRSS6Q8IU80 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMPRSS6Q8IU80 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMPRSS6Q8IU80 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMPRSS6Q8IU80 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMPRSS6Q8IU80 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMPRSS6Q8IU80 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMPRSS6Q8IU80 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TMPRSS6Q8IU80 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMPRSS6Q8IU80 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMPRSS6Q8IU80 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMPRSS6Q8IU80 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMPRSS6Q8IU80 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMPRSS6Q8IU80 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMPRSS6Q8IU80 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMPRSS6Q8IU80 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TMPRSS6Q8IU80 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMPRSS6Q8IU80 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMPRSS6Q8IU80 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMPRSS6Q8IU80 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMPRSS6Q8IU80 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMPRSS6Q8IU80 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMPRSS6Q8IU80 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMPRSS6Q8IU80 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
TMPRSS6Q8IU80 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TMPRSS6Q8IU80 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TMPRSS6Q8IU80 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMPRSS6Q8IU80 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TMPRSS6Q8IU80 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMPRSS6Q8IU80 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMPRSS6Q8IU80 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TMPRSS6Q8IU80 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMPRSS6Q8IU80 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMPRSS6Q8IU80 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMPRSS6Q8IU80 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMPRSS6Q8IU80 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMPRSS6Q8IU80 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMPRSS6Q8IU80 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMPRSS6Q8IU80 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMPRSS6Q8IU80 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMPRSS6Q8IU80 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMPRSS6Q8IU80 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMPRSS6Q8IU80 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMPRSS6Q8IU80 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMPRSS6Q8IU80 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMPRSS6Q8IU80 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMPRSS6Q8IU80 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TMPRSS6Q8IU80 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMPRSS6Q8IU80 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMPRSS6Q8IU80 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TMPRSS6Q8IU80 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMPRSS6Q8IU80 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMPRSS6Q8IU80 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMPRSS6Q8IU80 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMPRSS6Q8IU80 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMPRSS6Q8IU80 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMPRSS6Q8IU80 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMPRSS6Q8IU80 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMPRSS6Q8IU80 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TMPRSS6Q8IU80 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMPRSS6Q8IU80 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMPRSS6Q8IU80 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMPRSS6Q8IU80 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMPRSS6Q8IU80 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMPRSS6Q8IU80 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMPRSS6Q8IU80 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMPRSS6Q8IU80 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMPRSS6Q8IU80 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMPRSS6Q8IU80 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMPRSS6Q8IU80 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMPRSS6Q8IU80 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMPRSS6Q8IU80 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMPRSS6Q8IU80 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMPRSS6Q8IU80 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMPRSS6Q8IU80 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMPRSS6Q8IU80 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMPRSS6Q8IU80 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMPRSS6Q8IU80 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMPRSS6Q8IU80 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMPRSS6Q8IU80 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMPRSS6Q8IU80 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMPRSS6Q8IU80 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMPRSS6Q8IU80 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMPRSS6Q8IU80 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms