Protein–RNA interactions for Protein: Q86TL0

ATG4D, Cysteine protease ATG4D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4DQ86TL0 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATG4DQ86TL0 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATG4DQ86TL0 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATG4DQ86TL0 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATG4DQ86TL0 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATG4DQ86TL0 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATG4DQ86TL0 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
ATG4DQ86TL0 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
ATG4DQ86TL0 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
ATG4DQ86TL0 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
ATG4DQ86TL0 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATG4DQ86TL0 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATG4DQ86TL0 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATG4DQ86TL0 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATG4DQ86TL0 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
ATG4DQ86TL0 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATG4DQ86TL0 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATG4DQ86TL0 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATG4DQ86TL0 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATG4DQ86TL0 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATG4DQ86TL0 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATG4DQ86TL0 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATG4DQ86TL0 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
ATG4DQ86TL0 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATG4DQ86TL0 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATG4DQ86TL0 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATG4DQ86TL0 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATG4DQ86TL0 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATG4DQ86TL0 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATG4DQ86TL0 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATG4DQ86TL0 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATG4DQ86TL0 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATG4DQ86TL0 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATG4DQ86TL0 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATG4DQ86TL0 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATG4DQ86TL0 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
ATG4DQ86TL0 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATG4DQ86TL0 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
ATG4DQ86TL0 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATG4DQ86TL0 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATG4DQ86TL0 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATG4DQ86TL0 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATG4DQ86TL0 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATG4DQ86TL0 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATG4DQ86TL0 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATG4DQ86TL0 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
ATG4DQ86TL0 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATG4DQ86TL0 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATG4DQ86TL0 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATG4DQ86TL0 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
ATG4DQ86TL0 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATG4DQ86TL0 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATG4DQ86TL0 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATG4DQ86TL0 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
ATG4DQ86TL0 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATG4DQ86TL0 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATG4DQ86TL0 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATG4DQ86TL0 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATG4DQ86TL0 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATG4DQ86TL0 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATG4DQ86TL0 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATG4DQ86TL0 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATG4DQ86TL0 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATG4DQ86TL0 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATG4DQ86TL0 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATG4DQ86TL0 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATG4DQ86TL0 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATG4DQ86TL0 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATG4DQ86TL0 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATG4DQ86TL0 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATG4DQ86TL0 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
ATG4DQ86TL0 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
ATG4DQ86TL0 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATG4DQ86TL0 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATG4DQ86TL0 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATG4DQ86TL0 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
ATG4DQ86TL0 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATG4DQ86TL0 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATG4DQ86TL0 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATG4DQ86TL0 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATG4DQ86TL0 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATG4DQ86TL0 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATG4DQ86TL0 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATG4DQ86TL0 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATG4DQ86TL0 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATG4DQ86TL0 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATG4DQ86TL0 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
ATG4DQ86TL0 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATG4DQ86TL0 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATG4DQ86TL0 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATG4DQ86TL0 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATG4DQ86TL0 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATG4DQ86TL0 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATG4DQ86TL0 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATG4DQ86TL0 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATG4DQ86TL0 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATG4DQ86TL0 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATG4DQ86TL0 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATG4DQ86TL0 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATG4DQ86TL0 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms