Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7A3

CTU1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU1Q7Z7A3 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CTU1Q7Z7A3 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CTU1Q7Z7A3 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CTU1Q7Z7A3 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CTU1Q7Z7A3 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CTU1Q7Z7A3 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CTU1Q7Z7A3 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CTU1Q7Z7A3 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CTU1Q7Z7A3 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CTU1Q7Z7A3 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CTU1Q7Z7A3 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CTU1Q7Z7A3 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CTU1Q7Z7A3 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CTU1Q7Z7A3 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CTU1Q7Z7A3 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CTU1Q7Z7A3 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CTU1Q7Z7A3 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CTU1Q7Z7A3 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CTU1Q7Z7A3 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CTU1Q7Z7A3 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CTU1Q7Z7A3 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CTU1Q7Z7A3 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CTU1Q7Z7A3 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CTU1Q7Z7A3 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CTU1Q7Z7A3 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CTU1Q7Z7A3 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CTU1Q7Z7A3 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CTU1Q7Z7A3 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CTU1Q7Z7A3 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CTU1Q7Z7A3 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CTU1Q7Z7A3 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CTU1Q7Z7A3 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CTU1Q7Z7A3 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CTU1Q7Z7A3 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CTU1Q7Z7A3 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CTU1Q7Z7A3 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CTU1Q7Z7A3 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CTU1Q7Z7A3 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CTU1Q7Z7A3 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CTU1Q7Z7A3 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CTU1Q7Z7A3 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CTU1Q7Z7A3 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CTU1Q7Z7A3 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CTU1Q7Z7A3 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CTU1Q7Z7A3 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CTU1Q7Z7A3 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CTU1Q7Z7A3 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CTU1Q7Z7A3 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CTU1Q7Z7A3 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CTU1Q7Z7A3 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CTU1Q7Z7A3 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CTU1Q7Z7A3 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CTU1Q7Z7A3 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CTU1Q7Z7A3 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CTU1Q7Z7A3 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CTU1Q7Z7A3 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CTU1Q7Z7A3 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CTU1Q7Z7A3 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CTU1Q7Z7A3 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CTU1Q7Z7A3 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CTU1Q7Z7A3 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CTU1Q7Z7A3 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CTU1Q7Z7A3 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CTU1Q7Z7A3 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CTU1Q7Z7A3 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CTU1Q7Z7A3 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CTU1Q7Z7A3 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CTU1Q7Z7A3 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CTU1Q7Z7A3 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CTU1Q7Z7A3 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CTU1Q7Z7A3 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CTU1Q7Z7A3 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CTU1Q7Z7A3 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CTU1Q7Z7A3 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CTU1Q7Z7A3 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CTU1Q7Z7A3 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CTU1Q7Z7A3 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CTU1Q7Z7A3 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CTU1Q7Z7A3 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CTU1Q7Z7A3 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CTU1Q7Z7A3 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CTU1Q7Z7A3 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CTU1Q7Z7A3 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CTU1Q7Z7A3 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CTU1Q7Z7A3 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CTU1Q7Z7A3 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CTU1Q7Z7A3 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CTU1Q7Z7A3 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CTU1Q7Z7A3 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CTU1Q7Z7A3 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CTU1Q7Z7A3 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CTU1Q7Z7A3 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CTU1Q7Z7A3 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CTU1Q7Z7A3 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CTU1Q7Z7A3 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CTU1Q7Z7A3 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CTU1Q7Z7A3 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CTU1Q7Z7A3 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CTU1Q7Z7A3 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CTU1Q7Z7A3 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms