Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC9

SMIM5, Small integral membrane protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM5Q71RC9 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SMIM5Q71RC9 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SMIM5Q71RC9 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SMIM5Q71RC9 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SMIM5Q71RC9 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SMIM5Q71RC9 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SMIM5Q71RC9 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SMIM5Q71RC9 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SMIM5Q71RC9 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SMIM5Q71RC9 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
SMIM5Q71RC9 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
SMIM5Q71RC9 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
SMIM5Q71RC9 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SMIM5Q71RC9 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SMIM5Q71RC9 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SMIM5Q71RC9 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SMIM5Q71RC9 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
SMIM5Q71RC9 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
SMIM5Q71RC9 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SMIM5Q71RC9 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SMIM5Q71RC9 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SMIM5Q71RC9 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SMIM5Q71RC9 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SMIM5Q71RC9 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SMIM5Q71RC9 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SMIM5Q71RC9 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SMIM5Q71RC9 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SMIM5Q71RC9 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SMIM5Q71RC9 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SMIM5Q71RC9 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SMIM5Q71RC9 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SMIM5Q71RC9 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SMIM5Q71RC9 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SMIM5Q71RC9 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SMIM5Q71RC9 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SMIM5Q71RC9 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SMIM5Q71RC9 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SMIM5Q71RC9 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SMIM5Q71RC9 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SMIM5Q71RC9 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SMIM5Q71RC9 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
SMIM5Q71RC9 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
SMIM5Q71RC9 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SMIM5Q71RC9 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SMIM5Q71RC9 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SMIM5Q71RC9 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SMIM5Q71RC9 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SMIM5Q71RC9 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SMIM5Q71RC9 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SMIM5Q71RC9 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SMIM5Q71RC9 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SMIM5Q71RC9 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SMIM5Q71RC9 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SMIM5Q71RC9 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SMIM5Q71RC9 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SMIM5Q71RC9 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SMIM5Q71RC9 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SMIM5Q71RC9 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SMIM5Q71RC9 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SMIM5Q71RC9 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SMIM5Q71RC9 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SMIM5Q71RC9 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SMIM5Q71RC9 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SMIM5Q71RC9 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SMIM5Q71RC9 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SMIM5Q71RC9 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SMIM5Q71RC9 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SMIM5Q71RC9 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SMIM5Q71RC9 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SMIM5Q71RC9 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SMIM5Q71RC9 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SMIM5Q71RC9 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SMIM5Q71RC9 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SMIM5Q71RC9 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SMIM5Q71RC9 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SMIM5Q71RC9 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SMIM5Q71RC9 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SMIM5Q71RC9 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SMIM5Q71RC9 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
SMIM5Q71RC9 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SMIM5Q71RC9 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SMIM5Q71RC9 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SMIM5Q71RC9 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
SMIM5Q71RC9 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SMIM5Q71RC9 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SMIM5Q71RC9 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SMIM5Q71RC9 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SMIM5Q71RC9 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SMIM5Q71RC9 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SMIM5Q71RC9 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SMIM5Q71RC9 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SMIM5Q71RC9 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SMIM5Q71RC9 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SMIM5Q71RC9 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SMIM5Q71RC9 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SMIM5Q71RC9 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SMIM5Q71RC9 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SMIM5Q71RC9 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SMIM5Q71RC9 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SMIM5Q71RC9 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms