Protein–RNA interactions for Protein: Q71F23

CENPU, Centromere protein U, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPUQ71F23 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CENPUQ71F23 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CENPUQ71F23 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CENPUQ71F23 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CENPUQ71F23 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CENPUQ71F23 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CENPUQ71F23 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CENPUQ71F23 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CENPUQ71F23 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CENPUQ71F23 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CENPUQ71F23 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CENPUQ71F23 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CENPUQ71F23 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CENPUQ71F23 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CENPUQ71F23 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CENPUQ71F23 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CENPUQ71F23 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CENPUQ71F23 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CENPUQ71F23 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CENPUQ71F23 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CENPUQ71F23 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CENPUQ71F23 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CENPUQ71F23 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CENPUQ71F23 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CENPUQ71F23 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CENPUQ71F23 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CENPUQ71F23 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CENPUQ71F23 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CENPUQ71F23 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CENPUQ71F23 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CENPUQ71F23 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CENPUQ71F23 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CENPUQ71F23 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CENPUQ71F23 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CENPUQ71F23 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CENPUQ71F23 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CENPUQ71F23 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CENPUQ71F23 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CENPUQ71F23 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CENPUQ71F23 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CENPUQ71F23 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CENPUQ71F23 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CENPUQ71F23 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CENPUQ71F23 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CENPUQ71F23 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CENPUQ71F23 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CENPUQ71F23 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CENPUQ71F23 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CENPUQ71F23 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CENPUQ71F23 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CENPUQ71F23 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CENPUQ71F23 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CENPUQ71F23 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CENPUQ71F23 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CENPUQ71F23 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CENPUQ71F23 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CENPUQ71F23 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CENPUQ71F23 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CENPUQ71F23 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CENPUQ71F23 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CENPUQ71F23 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CENPUQ71F23 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CENPUQ71F23 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CENPUQ71F23 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CENPUQ71F23 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CENPUQ71F23 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CENPUQ71F23 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CENPUQ71F23 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CENPUQ71F23 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CENPUQ71F23 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CENPUQ71F23 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CENPUQ71F23 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CENPUQ71F23 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CENPUQ71F23 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CENPUQ71F23 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CENPUQ71F23 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CENPUQ71F23 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CENPUQ71F23 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CENPUQ71F23 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CENPUQ71F23 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CENPUQ71F23 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CENPUQ71F23 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CENPUQ71F23 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CENPUQ71F23 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CENPUQ71F23 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CENPUQ71F23 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CENPUQ71F23 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CENPUQ71F23 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CENPUQ71F23 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CENPUQ71F23 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CENPUQ71F23 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CENPUQ71F23 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CENPUQ71F23 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CENPUQ71F23 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CENPUQ71F23 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CENPUQ71F23 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CENPUQ71F23 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CENPUQ71F23 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CENPUQ71F23 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CENPUQ71F23 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms