Protein–RNA interactions for Protein: Q70UQ0

IKBIP, Inhibitor of nuclear factor kappa-B kinase-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IKBIPQ70UQ0 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
IKBIPQ70UQ0 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
IKBIPQ70UQ0 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
IKBIPQ70UQ0 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
IKBIPQ70UQ0 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
IKBIPQ70UQ0 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
IKBIPQ70UQ0 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
IKBIPQ70UQ0 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
IKBIPQ70UQ0 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
IKBIPQ70UQ0 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
IKBIPQ70UQ0 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
IKBIPQ70UQ0 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
IKBIPQ70UQ0 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
IKBIPQ70UQ0 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
IKBIPQ70UQ0 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
IKBIPQ70UQ0 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
IKBIPQ70UQ0 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
IKBIPQ70UQ0 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
IKBIPQ70UQ0 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
IKBIPQ70UQ0 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
IKBIPQ70UQ0 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
IKBIPQ70UQ0 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
IKBIPQ70UQ0 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
IKBIPQ70UQ0 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
IKBIPQ70UQ0 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
IKBIPQ70UQ0 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
IKBIPQ70UQ0 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
IKBIPQ70UQ0 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
IKBIPQ70UQ0 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
IKBIPQ70UQ0 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
IKBIPQ70UQ0 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
IKBIPQ70UQ0 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
IKBIPQ70UQ0 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
IKBIPQ70UQ0 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
IKBIPQ70UQ0 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
IKBIPQ70UQ0 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
IKBIPQ70UQ0 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
IKBIPQ70UQ0 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
IKBIPQ70UQ0 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
IKBIPQ70UQ0 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
IKBIPQ70UQ0 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
IKBIPQ70UQ0 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
IKBIPQ70UQ0 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
IKBIPQ70UQ0 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
IKBIPQ70UQ0 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
IKBIPQ70UQ0 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
IKBIPQ70UQ0 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
IKBIPQ70UQ0 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
IKBIPQ70UQ0 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
IKBIPQ70UQ0 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
IKBIPQ70UQ0 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
IKBIPQ70UQ0 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
IKBIPQ70UQ0 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
IKBIPQ70UQ0 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
IKBIPQ70UQ0 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
IKBIPQ70UQ0 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
IKBIPQ70UQ0 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
IKBIPQ70UQ0 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
IKBIPQ70UQ0 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
IKBIPQ70UQ0 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
IKBIPQ70UQ0 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
IKBIPQ70UQ0 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
IKBIPQ70UQ0 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
IKBIPQ70UQ0 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
IKBIPQ70UQ0 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
IKBIPQ70UQ0 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
IKBIPQ70UQ0 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
IKBIPQ70UQ0 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
IKBIPQ70UQ0 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
IKBIPQ70UQ0 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
IKBIPQ70UQ0 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
IKBIPQ70UQ0 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
IKBIPQ70UQ0 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
IKBIPQ70UQ0 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
IKBIPQ70UQ0 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
IKBIPQ70UQ0 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
IKBIPQ70UQ0 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
IKBIPQ70UQ0 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
IKBIPQ70UQ0 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
IKBIPQ70UQ0 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
IKBIPQ70UQ0 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
IKBIPQ70UQ0 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
IKBIPQ70UQ0 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
IKBIPQ70UQ0 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
IKBIPQ70UQ0 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
IKBIPQ70UQ0 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
IKBIPQ70UQ0 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
IKBIPQ70UQ0 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
IKBIPQ70UQ0 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
IKBIPQ70UQ0 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
IKBIPQ70UQ0 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
IKBIPQ70UQ0 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
IKBIPQ70UQ0 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
IKBIPQ70UQ0 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
IKBIPQ70UQ0 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
IKBIPQ70UQ0 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
IKBIPQ70UQ0 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
IKBIPQ70UQ0 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
IKBIPQ70UQ0 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
IKBIPQ70UQ0 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms