Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW61

BBS12, Bardet-Biedl syndrome 12 protein, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS12Q6ZW61 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BBS12Q6ZW61 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BBS12Q6ZW61 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BBS12Q6ZW61 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BBS12Q6ZW61 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BBS12Q6ZW61 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BBS12Q6ZW61 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BBS12Q6ZW61 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BBS12Q6ZW61 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BBS12Q6ZW61 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BBS12Q6ZW61 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BBS12Q6ZW61 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BBS12Q6ZW61 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BBS12Q6ZW61 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
BBS12Q6ZW61 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BBS12Q6ZW61 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BBS12Q6ZW61 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BBS12Q6ZW61 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BBS12Q6ZW61 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
BBS12Q6ZW61 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
BBS12Q6ZW61 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
BBS12Q6ZW61 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BBS12Q6ZW61 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
BBS12Q6ZW61 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BBS12Q6ZW61 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BBS12Q6ZW61 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BBS12Q6ZW61 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BBS12Q6ZW61 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BBS12Q6ZW61 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BBS12Q6ZW61 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BBS12Q6ZW61 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BBS12Q6ZW61 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BBS12Q6ZW61 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BBS12Q6ZW61 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BBS12Q6ZW61 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BBS12Q6ZW61 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BBS12Q6ZW61 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BBS12Q6ZW61 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
BBS12Q6ZW61 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
BBS12Q6ZW61 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BBS12Q6ZW61 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BBS12Q6ZW61 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BBS12Q6ZW61 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BBS12Q6ZW61 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BBS12Q6ZW61 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BBS12Q6ZW61 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
BBS12Q6ZW61 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BBS12Q6ZW61 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BBS12Q6ZW61 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BBS12Q6ZW61 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BBS12Q6ZW61 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BBS12Q6ZW61 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BBS12Q6ZW61 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BBS12Q6ZW61 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BBS12Q6ZW61 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BBS12Q6ZW61 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BBS12Q6ZW61 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BBS12Q6ZW61 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BBS12Q6ZW61 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BBS12Q6ZW61 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BBS12Q6ZW61 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BBS12Q6ZW61 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BBS12Q6ZW61 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BBS12Q6ZW61 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BBS12Q6ZW61 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BBS12Q6ZW61 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BBS12Q6ZW61 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BBS12Q6ZW61 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BBS12Q6ZW61 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BBS12Q6ZW61 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BBS12Q6ZW61 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BBS12Q6ZW61 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BBS12Q6ZW61 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BBS12Q6ZW61 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BBS12Q6ZW61 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
BBS12Q6ZW61 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BBS12Q6ZW61 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BBS12Q6ZW61 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BBS12Q6ZW61 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BBS12Q6ZW61 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BBS12Q6ZW61 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BBS12Q6ZW61 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BBS12Q6ZW61 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BBS12Q6ZW61 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BBS12Q6ZW61 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
BBS12Q6ZW61 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BBS12Q6ZW61 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BBS12Q6ZW61 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BBS12Q6ZW61 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BBS12Q6ZW61 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BBS12Q6ZW61 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BBS12Q6ZW61 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BBS12Q6ZW61 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BBS12Q6ZW61 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
BBS12Q6ZW61 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BBS12Q6ZW61 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BBS12Q6ZW61 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BBS12Q6ZW61 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BBS12Q6ZW61 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
BBS12Q6ZW61 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms