Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW31

SYDE1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYDE1Q6ZW31 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYDE1Q6ZW31 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYDE1Q6ZW31 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYDE1Q6ZW31 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYDE1Q6ZW31 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYDE1Q6ZW31 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYDE1Q6ZW31 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYDE1Q6ZW31 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYDE1Q6ZW31 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYDE1Q6ZW31 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYDE1Q6ZW31 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYDE1Q6ZW31 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYDE1Q6ZW31 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYDE1Q6ZW31 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYDE1Q6ZW31 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYDE1Q6ZW31 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYDE1Q6ZW31 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYDE1Q6ZW31 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYDE1Q6ZW31 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYDE1Q6ZW31 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYDE1Q6ZW31 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYDE1Q6ZW31 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYDE1Q6ZW31 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYDE1Q6ZW31 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYDE1Q6ZW31 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SYDE1Q6ZW31 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYDE1Q6ZW31 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYDE1Q6ZW31 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYDE1Q6ZW31 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYDE1Q6ZW31 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYDE1Q6ZW31 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SYDE1Q6ZW31 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYDE1Q6ZW31 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYDE1Q6ZW31 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYDE1Q6ZW31 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYDE1Q6ZW31 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYDE1Q6ZW31 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYDE1Q6ZW31 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYDE1Q6ZW31 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYDE1Q6ZW31 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYDE1Q6ZW31 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYDE1Q6ZW31 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SYDE1Q6ZW31 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYDE1Q6ZW31 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYDE1Q6ZW31 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYDE1Q6ZW31 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYDE1Q6ZW31 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYDE1Q6ZW31 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYDE1Q6ZW31 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYDE1Q6ZW31 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYDE1Q6ZW31 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYDE1Q6ZW31 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYDE1Q6ZW31 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYDE1Q6ZW31 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYDE1Q6ZW31 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYDE1Q6ZW31 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SYDE1Q6ZW31 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYDE1Q6ZW31 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SYDE1Q6ZW31 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SYDE1Q6ZW31 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SYDE1Q6ZW31 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYDE1Q6ZW31 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYDE1Q6ZW31 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYDE1Q6ZW31 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYDE1Q6ZW31 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYDE1Q6ZW31 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SYDE1Q6ZW31 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYDE1Q6ZW31 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYDE1Q6ZW31 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYDE1Q6ZW31 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYDE1Q6ZW31 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYDE1Q6ZW31 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYDE1Q6ZW31 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYDE1Q6ZW31 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYDE1Q6ZW31 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYDE1Q6ZW31 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYDE1Q6ZW31 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYDE1Q6ZW31 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYDE1Q6ZW31 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYDE1Q6ZW31 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYDE1Q6ZW31 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYDE1Q6ZW31 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYDE1Q6ZW31 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYDE1Q6ZW31 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYDE1Q6ZW31 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYDE1Q6ZW31 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYDE1Q6ZW31 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYDE1Q6ZW31 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SYDE1Q6ZW31 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYDE1Q6ZW31 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SYDE1Q6ZW31 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYDE1Q6ZW31 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYDE1Q6ZW31 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYDE1Q6ZW31 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYDE1Q6ZW31 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYDE1Q6ZW31 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYDE1Q6ZW31 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYDE1Q6ZW31 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYDE1Q6ZW31 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYDE1Q6ZW31 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107 ms