Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSC3

RBM43, RNA-binding protein 43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM43Q6ZSC3 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RBM43Q6ZSC3 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RBM43Q6ZSC3 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RBM43Q6ZSC3 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RBM43Q6ZSC3 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RBM43Q6ZSC3 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RBM43Q6ZSC3 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RBM43Q6ZSC3 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
RBM43Q6ZSC3 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RBM43Q6ZSC3 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RBM43Q6ZSC3 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RBM43Q6ZSC3 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RBM43Q6ZSC3 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RBM43Q6ZSC3 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RBM43Q6ZSC3 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RBM43Q6ZSC3 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RBM43Q6ZSC3 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RBM43Q6ZSC3 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RBM43Q6ZSC3 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RBM43Q6ZSC3 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RBM43Q6ZSC3 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RBM43Q6ZSC3 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RBM43Q6ZSC3 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RBM43Q6ZSC3 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RBM43Q6ZSC3 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RBM43Q6ZSC3 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RBM43Q6ZSC3 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RBM43Q6ZSC3 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RBM43Q6ZSC3 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
RBM43Q6ZSC3 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RBM43Q6ZSC3 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RBM43Q6ZSC3 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RBM43Q6ZSC3 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RBM43Q6ZSC3 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RBM43Q6ZSC3 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RBM43Q6ZSC3 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RBM43Q6ZSC3 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
RBM43Q6ZSC3 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
RBM43Q6ZSC3 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
RBM43Q6ZSC3 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RBM43Q6ZSC3 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
RBM43Q6ZSC3 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RBM43Q6ZSC3 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RBM43Q6ZSC3 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RBM43Q6ZSC3 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RBM43Q6ZSC3 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RBM43Q6ZSC3 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RBM43Q6ZSC3 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RBM43Q6ZSC3 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RBM43Q6ZSC3 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RBM43Q6ZSC3 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RBM43Q6ZSC3 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RBM43Q6ZSC3 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RBM43Q6ZSC3 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RBM43Q6ZSC3 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RBM43Q6ZSC3 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RBM43Q6ZSC3 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RBM43Q6ZSC3 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
RBM43Q6ZSC3 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RBM43Q6ZSC3 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RBM43Q6ZSC3 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RBM43Q6ZSC3 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RBM43Q6ZSC3 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RBM43Q6ZSC3 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RBM43Q6ZSC3 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RBM43Q6ZSC3 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RBM43Q6ZSC3 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RBM43Q6ZSC3 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RBM43Q6ZSC3 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RBM43Q6ZSC3 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
RBM43Q6ZSC3 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RBM43Q6ZSC3 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RBM43Q6ZSC3 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RBM43Q6ZSC3 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RBM43Q6ZSC3 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
RBM43Q6ZSC3 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RBM43Q6ZSC3 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RBM43Q6ZSC3 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RBM43Q6ZSC3 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
RBM43Q6ZSC3 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RBM43Q6ZSC3 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RBM43Q6ZSC3 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RBM43Q6ZSC3 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RBM43Q6ZSC3 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RBM43Q6ZSC3 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RBM43Q6ZSC3 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RBM43Q6ZSC3 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RBM43Q6ZSC3 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RBM43Q6ZSC3 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RBM43Q6ZSC3 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RBM43Q6ZSC3 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RBM43Q6ZSC3 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RBM43Q6ZSC3 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RBM43Q6ZSC3 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RBM43Q6ZSC3 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RBM43Q6ZSC3 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RBM43Q6ZSC3 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RBM43Q6ZSC3 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RBM43Q6ZSC3 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RBM43Q6ZSC3 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms