Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSA7

LRRC55, Leucine-rich repeat-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC55Q6ZSA7 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRC55Q6ZSA7 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRRC55Q6ZSA7 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRRC55Q6ZSA7 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRRC55Q6ZSA7 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRRC55Q6ZSA7 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRRC55Q6ZSA7 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRRC55Q6ZSA7 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRRC55Q6ZSA7 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRRC55Q6ZSA7 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRC55Q6ZSA7 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRC55Q6ZSA7 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRC55Q6ZSA7 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRC55Q6ZSA7 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRC55Q6ZSA7 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRC55Q6ZSA7 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRC55Q6ZSA7 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRC55Q6ZSA7 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRC55Q6ZSA7 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRC55Q6ZSA7 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRC55Q6ZSA7 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRC55Q6ZSA7 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRC55Q6ZSA7 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRC55Q6ZSA7 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRC55Q6ZSA7 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRC55Q6ZSA7 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRC55Q6ZSA7 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRC55Q6ZSA7 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRC55Q6ZSA7 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRC55Q6ZSA7 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRC55Q6ZSA7 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRC55Q6ZSA7 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRC55Q6ZSA7 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRC55Q6ZSA7 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRC55Q6ZSA7 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRC55Q6ZSA7 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRC55Q6ZSA7 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRRC55Q6ZSA7 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRRC55Q6ZSA7 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRRC55Q6ZSA7 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRRC55Q6ZSA7 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRRC55Q6ZSA7 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRRC55Q6ZSA7 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRRC55Q6ZSA7 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRC55Q6ZSA7 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRC55Q6ZSA7 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRC55Q6ZSA7 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRC55Q6ZSA7 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRC55Q6ZSA7 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRC55Q6ZSA7 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRC55Q6ZSA7 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRC55Q6ZSA7 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRC55Q6ZSA7 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRC55Q6ZSA7 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRC55Q6ZSA7 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRC55Q6ZSA7 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRC55Q6ZSA7 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRC55Q6ZSA7 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRC55Q6ZSA7 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRC55Q6ZSA7 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRC55Q6ZSA7 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRC55Q6ZSA7 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRC55Q6ZSA7 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRC55Q6ZSA7 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRC55Q6ZSA7 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRC55Q6ZSA7 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRC55Q6ZSA7 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRC55Q6ZSA7 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRC55Q6ZSA7 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRC55Q6ZSA7 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRC55Q6ZSA7 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRC55Q6ZSA7 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRC55Q6ZSA7 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRC55Q6ZSA7 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRC55Q6ZSA7 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRC55Q6ZSA7 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRC55Q6ZSA7 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRC55Q6ZSA7 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRC55Q6ZSA7 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRC55Q6ZSA7 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRC55Q6ZSA7 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRC55Q6ZSA7 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRC55Q6ZSA7 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRC55Q6ZSA7 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRC55Q6ZSA7 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRC55Q6ZSA7 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRC55Q6ZSA7 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRC55Q6ZSA7 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRC55Q6ZSA7 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRC55Q6ZSA7 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRC55Q6ZSA7 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRC55Q6ZSA7 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRC55Q6ZSA7 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRC55Q6ZSA7 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRC55Q6ZSA7 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRC55Q6ZSA7 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRC55Q6ZSA7 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRC55Q6ZSA7 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRC55Q6ZSA7 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LRRC55Q6ZSA7 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms