Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQX7

LIAT1, Protein LIAT1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIAT1Q6ZQX7 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LIAT1Q6ZQX7 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LIAT1Q6ZQX7 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LIAT1Q6ZQX7 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LIAT1Q6ZQX7 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LIAT1Q6ZQX7 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LIAT1Q6ZQX7 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LIAT1Q6ZQX7 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LIAT1Q6ZQX7 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LIAT1Q6ZQX7 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LIAT1Q6ZQX7 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LIAT1Q6ZQX7 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LIAT1Q6ZQX7 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
LIAT1Q6ZQX7 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LIAT1Q6ZQX7 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LIAT1Q6ZQX7 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LIAT1Q6ZQX7 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LIAT1Q6ZQX7 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LIAT1Q6ZQX7 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LIAT1Q6ZQX7 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LIAT1Q6ZQX7 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LIAT1Q6ZQX7 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LIAT1Q6ZQX7 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LIAT1Q6ZQX7 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LIAT1Q6ZQX7 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LIAT1Q6ZQX7 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LIAT1Q6ZQX7 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LIAT1Q6ZQX7 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LIAT1Q6ZQX7 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LIAT1Q6ZQX7 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
LIAT1Q6ZQX7 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LIAT1Q6ZQX7 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LIAT1Q6ZQX7 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LIAT1Q6ZQX7 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LIAT1Q6ZQX7 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LIAT1Q6ZQX7 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LIAT1Q6ZQX7 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
LIAT1Q6ZQX7 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LIAT1Q6ZQX7 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
LIAT1Q6ZQX7 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LIAT1Q6ZQX7 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LIAT1Q6ZQX7 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LIAT1Q6ZQX7 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LIAT1Q6ZQX7 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LIAT1Q6ZQX7 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LIAT1Q6ZQX7 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LIAT1Q6ZQX7 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LIAT1Q6ZQX7 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LIAT1Q6ZQX7 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
LIAT1Q6ZQX7 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LIAT1Q6ZQX7 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LIAT1Q6ZQX7 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LIAT1Q6ZQX7 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LIAT1Q6ZQX7 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LIAT1Q6ZQX7 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
LIAT1Q6ZQX7 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LIAT1Q6ZQX7 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LIAT1Q6ZQX7 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LIAT1Q6ZQX7 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LIAT1Q6ZQX7 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LIAT1Q6ZQX7 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LIAT1Q6ZQX7 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LIAT1Q6ZQX7 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LIAT1Q6ZQX7 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LIAT1Q6ZQX7 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LIAT1Q6ZQX7 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LIAT1Q6ZQX7 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LIAT1Q6ZQX7 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LIAT1Q6ZQX7 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LIAT1Q6ZQX7 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LIAT1Q6ZQX7 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LIAT1Q6ZQX7 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LIAT1Q6ZQX7 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LIAT1Q6ZQX7 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LIAT1Q6ZQX7 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
LIAT1Q6ZQX7 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LIAT1Q6ZQX7 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LIAT1Q6ZQX7 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LIAT1Q6ZQX7 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LIAT1Q6ZQX7 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LIAT1Q6ZQX7 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LIAT1Q6ZQX7 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
LIAT1Q6ZQX7 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LIAT1Q6ZQX7 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LIAT1Q6ZQX7 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LIAT1Q6ZQX7 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LIAT1Q6ZQX7 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LIAT1Q6ZQX7 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
LIAT1Q6ZQX7 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
LIAT1Q6ZQX7 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LIAT1Q6ZQX7 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LIAT1Q6ZQX7 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LIAT1Q6ZQX7 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LIAT1Q6ZQX7 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LIAT1Q6ZQX7 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LIAT1Q6ZQX7 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LIAT1Q6ZQX7 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LIAT1Q6ZQX7 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LIAT1Q6ZQX7 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
LIAT1Q6ZQX7 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms