Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZP82

CCDC141, Coiled-coil domain-containing protein 141, humanhuman

Predictions only

Length 1,450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC141Q6ZP82 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
CCDC141Q6ZP82 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
CCDC141Q6ZP82 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
CCDC141Q6ZP82 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
CCDC141Q6ZP82 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
CCDC141Q6ZP82 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
CCDC141Q6ZP82 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC33.3■■■□□ 2.92
CCDC141Q6ZP82 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
CCDC141Q6ZP82 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
CCDC141Q6ZP82 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
CCDC141Q6ZP82 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
CCDC141Q6ZP82 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
CCDC141Q6ZP82 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
CCDC141Q6ZP82 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
CCDC141Q6ZP82 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
CCDC141Q6ZP82 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
CCDC141Q6ZP82 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
CCDC141Q6ZP82 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
CCDC141Q6ZP82 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
CCDC141Q6ZP82 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
CCDC141Q6ZP82 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
CCDC141Q6ZP82 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
CCDC141Q6ZP82 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
CCDC141Q6ZP82 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
CCDC141Q6ZP82 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC33.28■■■□□ 2.92
CCDC141Q6ZP82 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
CCDC141Q6ZP82 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC33.28■■■□□ 2.92
CCDC141Q6ZP82 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
CCDC141Q6ZP82 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
CCDC141Q6ZP82 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
CCDC141Q6ZP82 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
CCDC141Q6ZP82 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
CCDC141Q6ZP82 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
CCDC141Q6ZP82 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
CCDC141Q6ZP82 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
CCDC141Q6ZP82 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
CCDC141Q6ZP82 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.92
CCDC141Q6ZP82 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
CCDC141Q6ZP82 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
CCDC141Q6ZP82 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC33.26■■■□□ 2.92
CCDC141Q6ZP82 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.92
CCDC141Q6ZP82 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
CCDC141Q6ZP82 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
CCDC141Q6ZP82 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
CCDC141Q6ZP82 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
CCDC141Q6ZP82 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
CCDC141Q6ZP82 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
CCDC141Q6ZP82 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
CCDC141Q6ZP82 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
CCDC141Q6ZP82 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
CCDC141Q6ZP82 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
CCDC141Q6ZP82 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
CCDC141Q6ZP82 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC33.24■■■□□ 2.91
CCDC141Q6ZP82 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC33.24■■■□□ 2.91
CCDC141Q6ZP82 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
CCDC141Q6ZP82 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
CCDC141Q6ZP82 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
CCDC141Q6ZP82 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
CCDC141Q6ZP82 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
CCDC141Q6ZP82 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
CCDC141Q6ZP82 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC33.23■■■□□ 2.91
CCDC141Q6ZP82 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
CCDC141Q6ZP82 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
CCDC141Q6ZP82 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
CCDC141Q6ZP82 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
CCDC141Q6ZP82 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
CCDC141Q6ZP82 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
CCDC141Q6ZP82 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
CCDC141Q6ZP82 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
CCDC141Q6ZP82 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
CCDC141Q6ZP82 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
CCDC141Q6ZP82 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
CCDC141Q6ZP82 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
CCDC141Q6ZP82 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
CCDC141Q6ZP82 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
CCDC141Q6ZP82 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
CCDC141Q6ZP82 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
CCDC141Q6ZP82 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
CCDC141Q6ZP82 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC33.2■■■□□ 2.91
CCDC141Q6ZP82 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
CCDC141Q6ZP82 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
CCDC141Q6ZP82 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
CCDC141Q6ZP82 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
CCDC141Q6ZP82 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
CCDC141Q6ZP82 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
CCDC141Q6ZP82 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
CCDC141Q6ZP82 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
CCDC141Q6ZP82 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
CCDC141Q6ZP82 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
CCDC141Q6ZP82 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
CCDC141Q6ZP82 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
CCDC141Q6ZP82 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
CCDC141Q6ZP82 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
CCDC141Q6ZP82 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
CCDC141Q6ZP82 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
CCDC141Q6ZP82 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
CCDC141Q6ZP82 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
CCDC141Q6ZP82 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
CCDC141Q6ZP82 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
CCDC141Q6ZP82 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC33.18■■■□□ 2.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms