Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMN8

CCNI2, Cyclin-I2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNI2Q6ZMN8 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCNI2Q6ZMN8 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCNI2Q6ZMN8 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCNI2Q6ZMN8 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCNI2Q6ZMN8 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCNI2Q6ZMN8 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCNI2Q6ZMN8 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCNI2Q6ZMN8 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCNI2Q6ZMN8 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCNI2Q6ZMN8 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCNI2Q6ZMN8 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCNI2Q6ZMN8 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCNI2Q6ZMN8 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCNI2Q6ZMN8 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCNI2Q6ZMN8 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCNI2Q6ZMN8 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CCNI2Q6ZMN8 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCNI2Q6ZMN8 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCNI2Q6ZMN8 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCNI2Q6ZMN8 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCNI2Q6ZMN8 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCNI2Q6ZMN8 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCNI2Q6ZMN8 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCNI2Q6ZMN8 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCNI2Q6ZMN8 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCNI2Q6ZMN8 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCNI2Q6ZMN8 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCNI2Q6ZMN8 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCNI2Q6ZMN8 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CCNI2Q6ZMN8 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCNI2Q6ZMN8 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCNI2Q6ZMN8 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCNI2Q6ZMN8 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCNI2Q6ZMN8 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCNI2Q6ZMN8 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCNI2Q6ZMN8 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCNI2Q6ZMN8 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCNI2Q6ZMN8 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCNI2Q6ZMN8 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCNI2Q6ZMN8 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCNI2Q6ZMN8 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCNI2Q6ZMN8 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCNI2Q6ZMN8 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCNI2Q6ZMN8 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCNI2Q6ZMN8 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCNI2Q6ZMN8 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCNI2Q6ZMN8 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCNI2Q6ZMN8 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CCNI2Q6ZMN8 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCNI2Q6ZMN8 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCNI2Q6ZMN8 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCNI2Q6ZMN8 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCNI2Q6ZMN8 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCNI2Q6ZMN8 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CCNI2Q6ZMN8 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCNI2Q6ZMN8 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCNI2Q6ZMN8 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCNI2Q6ZMN8 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCNI2Q6ZMN8 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCNI2Q6ZMN8 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCNI2Q6ZMN8 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCNI2Q6ZMN8 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCNI2Q6ZMN8 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCNI2Q6ZMN8 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCNI2Q6ZMN8 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCNI2Q6ZMN8 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCNI2Q6ZMN8 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCNI2Q6ZMN8 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCNI2Q6ZMN8 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCNI2Q6ZMN8 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCNI2Q6ZMN8 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCNI2Q6ZMN8 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCNI2Q6ZMN8 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCNI2Q6ZMN8 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCNI2Q6ZMN8 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCNI2Q6ZMN8 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCNI2Q6ZMN8 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCNI2Q6ZMN8 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCNI2Q6ZMN8 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCNI2Q6ZMN8 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCNI2Q6ZMN8 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCNI2Q6ZMN8 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCNI2Q6ZMN8 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCNI2Q6ZMN8 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCNI2Q6ZMN8 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CCNI2Q6ZMN8 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCNI2Q6ZMN8 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCNI2Q6ZMN8 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCNI2Q6ZMN8 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCNI2Q6ZMN8 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCNI2Q6ZMN8 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCNI2Q6ZMN8 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCNI2Q6ZMN8 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCNI2Q6ZMN8 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CCNI2Q6ZMN8 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCNI2Q6ZMN8 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCNI2Q6ZMN8 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCNI2Q6ZMN8 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCNI2Q6ZMN8 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCNI2Q6ZMN8 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms