Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXD1

HRCT1, Histidine-rich carboxyl terminus protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRCT1Q6UXD1 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HRCT1Q6UXD1 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
HRCT1Q6UXD1 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HRCT1Q6UXD1 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HRCT1Q6UXD1 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
HRCT1Q6UXD1 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HRCT1Q6UXD1 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HRCT1Q6UXD1 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
HRCT1Q6UXD1 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HRCT1Q6UXD1 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HRCT1Q6UXD1 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HRCT1Q6UXD1 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HRCT1Q6UXD1 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HRCT1Q6UXD1 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HRCT1Q6UXD1 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HRCT1Q6UXD1 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HRCT1Q6UXD1 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HRCT1Q6UXD1 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HRCT1Q6UXD1 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HRCT1Q6UXD1 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HRCT1Q6UXD1 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HRCT1Q6UXD1 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HRCT1Q6UXD1 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HRCT1Q6UXD1 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HRCT1Q6UXD1 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HRCT1Q6UXD1 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HRCT1Q6UXD1 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HRCT1Q6UXD1 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HRCT1Q6UXD1 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HRCT1Q6UXD1 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HRCT1Q6UXD1 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HRCT1Q6UXD1 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HRCT1Q6UXD1 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HRCT1Q6UXD1 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HRCT1Q6UXD1 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HRCT1Q6UXD1 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HRCT1Q6UXD1 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HRCT1Q6UXD1 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HRCT1Q6UXD1 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
HRCT1Q6UXD1 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HRCT1Q6UXD1 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HRCT1Q6UXD1 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
HRCT1Q6UXD1 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HRCT1Q6UXD1 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HRCT1Q6UXD1 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HRCT1Q6UXD1 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
HRCT1Q6UXD1 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HRCT1Q6UXD1 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HRCT1Q6UXD1 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HRCT1Q6UXD1 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HRCT1Q6UXD1 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HRCT1Q6UXD1 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HRCT1Q6UXD1 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HRCT1Q6UXD1 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HRCT1Q6UXD1 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HRCT1Q6UXD1 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HRCT1Q6UXD1 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HRCT1Q6UXD1 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HRCT1Q6UXD1 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HRCT1Q6UXD1 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
HRCT1Q6UXD1 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
HRCT1Q6UXD1 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HRCT1Q6UXD1 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HRCT1Q6UXD1 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HRCT1Q6UXD1 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HRCT1Q6UXD1 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HRCT1Q6UXD1 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HRCT1Q6UXD1 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HRCT1Q6UXD1 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HRCT1Q6UXD1 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HRCT1Q6UXD1 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HRCT1Q6UXD1 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HRCT1Q6UXD1 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HRCT1Q6UXD1 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HRCT1Q6UXD1 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
HRCT1Q6UXD1 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
HRCT1Q6UXD1 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HRCT1Q6UXD1 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HRCT1Q6UXD1 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HRCT1Q6UXD1 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HRCT1Q6UXD1 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HRCT1Q6UXD1 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HRCT1Q6UXD1 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HRCT1Q6UXD1 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HRCT1Q6UXD1 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HRCT1Q6UXD1 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HRCT1Q6UXD1 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HRCT1Q6UXD1 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HRCT1Q6UXD1 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HRCT1Q6UXD1 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HRCT1Q6UXD1 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HRCT1Q6UXD1 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HRCT1Q6UXD1 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HRCT1Q6UXD1 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HRCT1Q6UXD1 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HRCT1Q6UXD1 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HRCT1Q6UXD1 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HRCT1Q6UXD1 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HRCT1Q6UXD1 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HRCT1Q6UXD1 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms