Protein–RNA interactions for Protein: Q6U841

SLC4A10, Sodium-driven chloride bicarbonate exchanger, humanhuman

Predictions only

Length 1,118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A10Q6U841 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SLC4A10Q6U841 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SLC4A10Q6U841 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SLC4A10Q6U841 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SLC4A10Q6U841 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SLC4A10Q6U841 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SLC4A10Q6U841 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SLC4A10Q6U841 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SLC4A10Q6U841 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SLC4A10Q6U841 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SLC4A10Q6U841 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SLC4A10Q6U841 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SLC4A10Q6U841 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SLC4A10Q6U841 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SLC4A10Q6U841 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SLC4A10Q6U841 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SLC4A10Q6U841 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SLC4A10Q6U841 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SLC4A10Q6U841 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SLC4A10Q6U841 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SLC4A10Q6U841 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SLC4A10Q6U841 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SLC4A10Q6U841 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SLC4A10Q6U841 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SLC4A10Q6U841 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SLC4A10Q6U841 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SLC4A10Q6U841 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SLC4A10Q6U841 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SLC4A10Q6U841 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SLC4A10Q6U841 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SLC4A10Q6U841 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SLC4A10Q6U841 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SLC4A10Q6U841 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SLC4A10Q6U841 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SLC4A10Q6U841 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SLC4A10Q6U841 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SLC4A10Q6U841 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SLC4A10Q6U841 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SLC4A10Q6U841 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SLC4A10Q6U841 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SLC4A10Q6U841 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SLC4A10Q6U841 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SLC4A10Q6U841 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SLC4A10Q6U841 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SLC4A10Q6U841 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SLC4A10Q6U841 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SLC4A10Q6U841 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SLC4A10Q6U841 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SLC4A10Q6U841 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SLC4A10Q6U841 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
SLC4A10Q6U841 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SLC4A10Q6U841 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SLC4A10Q6U841 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SLC4A10Q6U841 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SLC4A10Q6U841 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SLC4A10Q6U841 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SLC4A10Q6U841 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SLC4A10Q6U841 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SLC4A10Q6U841 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SLC4A10Q6U841 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SLC4A10Q6U841 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SLC4A10Q6U841 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SLC4A10Q6U841 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SLC4A10Q6U841 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SLC4A10Q6U841 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SLC4A10Q6U841 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SLC4A10Q6U841 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SLC4A10Q6U841 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SLC4A10Q6U841 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SLC4A10Q6U841 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SLC4A10Q6U841 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SLC4A10Q6U841 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SLC4A10Q6U841 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SLC4A10Q6U841 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SLC4A10Q6U841 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.04
SLC4A10Q6U841 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SLC4A10Q6U841 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SLC4A10Q6U841 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SLC4A10Q6U841 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SLC4A10Q6U841 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SLC4A10Q6U841 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SLC4A10Q6U841 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SLC4A10Q6U841 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SLC4A10Q6U841 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SLC4A10Q6U841 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SLC4A10Q6U841 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SLC4A10Q6U841 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SLC4A10Q6U841 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SLC4A10Q6U841 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SLC4A10Q6U841 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SLC4A10Q6U841 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SLC4A10Q6U841 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SLC4A10Q6U841 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SLC4A10Q6U841 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SLC4A10Q6U841 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SLC4A10Q6U841 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
SLC4A10Q6U841 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SLC4A10Q6U841 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SLC4A10Q6U841 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SLC4A10Q6U841 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms