Protein–RNA interactions for Protein: Q6QAJ8

TMEM220, Transmembrane protein 220, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM220Q6QAJ8 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM220Q6QAJ8 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM220Q6QAJ8 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM220Q6QAJ8 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM220Q6QAJ8 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM220Q6QAJ8 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM220Q6QAJ8 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM220Q6QAJ8 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM220Q6QAJ8 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM220Q6QAJ8 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM220Q6QAJ8 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM220Q6QAJ8 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM220Q6QAJ8 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMEM220Q6QAJ8 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMEM220Q6QAJ8 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMEM220Q6QAJ8 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMEM220Q6QAJ8 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMEM220Q6QAJ8 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMEM220Q6QAJ8 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TMEM220Q6QAJ8 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMEM220Q6QAJ8 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMEM220Q6QAJ8 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMEM220Q6QAJ8 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMEM220Q6QAJ8 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMEM220Q6QAJ8 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMEM220Q6QAJ8 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMEM220Q6QAJ8 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMEM220Q6QAJ8 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMEM220Q6QAJ8 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMEM220Q6QAJ8 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMEM220Q6QAJ8 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMEM220Q6QAJ8 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMEM220Q6QAJ8 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMEM220Q6QAJ8 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMEM220Q6QAJ8 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMEM220Q6QAJ8 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMEM220Q6QAJ8 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMEM220Q6QAJ8 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMEM220Q6QAJ8 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMEM220Q6QAJ8 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMEM220Q6QAJ8 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMEM220Q6QAJ8 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMEM220Q6QAJ8 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM220Q6QAJ8 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM220Q6QAJ8 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM220Q6QAJ8 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM220Q6QAJ8 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM220Q6QAJ8 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM220Q6QAJ8 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM220Q6QAJ8 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM220Q6QAJ8 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM220Q6QAJ8 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM220Q6QAJ8 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM220Q6QAJ8 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM220Q6QAJ8 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM220Q6QAJ8 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM220Q6QAJ8 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM220Q6QAJ8 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM220Q6QAJ8 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM220Q6QAJ8 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM220Q6QAJ8 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM220Q6QAJ8 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM220Q6QAJ8 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM220Q6QAJ8 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM220Q6QAJ8 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM220Q6QAJ8 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM220Q6QAJ8 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM220Q6QAJ8 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM220Q6QAJ8 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM220Q6QAJ8 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM220Q6QAJ8 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM220Q6QAJ8 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM220Q6QAJ8 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM220Q6QAJ8 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM220Q6QAJ8 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM220Q6QAJ8 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM220Q6QAJ8 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM220Q6QAJ8 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM220Q6QAJ8 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM220Q6QAJ8 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM220Q6QAJ8 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM220Q6QAJ8 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM220Q6QAJ8 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM220Q6QAJ8 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM220Q6QAJ8 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM220Q6QAJ8 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM220Q6QAJ8 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM220Q6QAJ8 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM220Q6QAJ8 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM220Q6QAJ8 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM220Q6QAJ8 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM220Q6QAJ8 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM220Q6QAJ8 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM220Q6QAJ8 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM220Q6QAJ8 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM220Q6QAJ8 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM220Q6QAJ8 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM220Q6QAJ8 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM220Q6QAJ8 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM220Q6QAJ8 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms