Protein–RNA interactions for Protein: Q6PF15

KLHL35, Kelch-like protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL35Q6PF15 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KLHL35Q6PF15 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KLHL35Q6PF15 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KLHL35Q6PF15 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KLHL35Q6PF15 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
KLHL35Q6PF15 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KLHL35Q6PF15 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KLHL35Q6PF15 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KLHL35Q6PF15 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KLHL35Q6PF15 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
KLHL35Q6PF15 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KLHL35Q6PF15 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KLHL35Q6PF15 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
KLHL35Q6PF15 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KLHL35Q6PF15 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KLHL35Q6PF15 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KLHL35Q6PF15 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KLHL35Q6PF15 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KLHL35Q6PF15 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KLHL35Q6PF15 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KLHL35Q6PF15 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KLHL35Q6PF15 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KLHL35Q6PF15 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KLHL35Q6PF15 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KLHL35Q6PF15 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
KLHL35Q6PF15 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KLHL35Q6PF15 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KLHL35Q6PF15 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KLHL35Q6PF15 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KLHL35Q6PF15 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
KLHL35Q6PF15 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
KLHL35Q6PF15 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KLHL35Q6PF15 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KLHL35Q6PF15 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KLHL35Q6PF15 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KLHL35Q6PF15 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KLHL35Q6PF15 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KLHL35Q6PF15 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KLHL35Q6PF15 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KLHL35Q6PF15 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KLHL35Q6PF15 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KLHL35Q6PF15 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KLHL35Q6PF15 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KLHL35Q6PF15 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KLHL35Q6PF15 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KLHL35Q6PF15 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KLHL35Q6PF15 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KLHL35Q6PF15 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KLHL35Q6PF15 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KLHL35Q6PF15 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KLHL35Q6PF15 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
KLHL35Q6PF15 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KLHL35Q6PF15 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KLHL35Q6PF15 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KLHL35Q6PF15 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KLHL35Q6PF15 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KLHL35Q6PF15 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KLHL35Q6PF15 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KLHL35Q6PF15 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KLHL35Q6PF15 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KLHL35Q6PF15 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KLHL35Q6PF15 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KLHL35Q6PF15 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KLHL35Q6PF15 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
KLHL35Q6PF15 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KLHL35Q6PF15 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KLHL35Q6PF15 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KLHL35Q6PF15 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
KLHL35Q6PF15 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
KLHL35Q6PF15 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
KLHL35Q6PF15 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
KLHL35Q6PF15 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
KLHL35Q6PF15 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KLHL35Q6PF15 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KLHL35Q6PF15 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KLHL35Q6PF15 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KLHL35Q6PF15 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KLHL35Q6PF15 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KLHL35Q6PF15 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KLHL35Q6PF15 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KLHL35Q6PF15 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KLHL35Q6PF15 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KLHL35Q6PF15 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KLHL35Q6PF15 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KLHL35Q6PF15 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KLHL35Q6PF15 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KLHL35Q6PF15 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KLHL35Q6PF15 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KLHL35Q6PF15 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KLHL35Q6PF15 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KLHL35Q6PF15 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
KLHL35Q6PF15 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KLHL35Q6PF15 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
KLHL35Q6PF15 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KLHL35Q6PF15 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KLHL35Q6PF15 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KLHL35Q6PF15 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KLHL35Q6PF15 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KLHL35Q6PF15 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KLHL35Q6PF15 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms